33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3121 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  813    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14620  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.32 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00393571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1702  hypothetical protein  48.85 
 
 
290 aa  162  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2376  hypothetical protein  33.8 
 
 
421 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1909  hypothetical protein  30.24 
 
 
421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000148245  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03332  hypothetical protein  41.18 
 
 
606 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  37.64 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0433  exonuclease-like protein  33.79 
 
 
423 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0079  hypothetical protein  39.44 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.418653 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0995  exonuclease-like protein  26.6 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0279  hypothetical protein  34.07 
 
 
361 aa  90.9  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2219  exonuclease-like protein  35.05 
 
 
386 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2252  hypothetical protein  32.95 
 
 
362 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.207907  normal  0.25741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  30.68 
 
 
277 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  24.71 
 
 
249 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  29.48 
 
 
277 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  31.55 
 
 
168 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  22.64 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  31.03 
 
 
168 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  26.7 
 
 
254 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  31.14 
 
 
251 aa  54.3  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0672  hypothetical protein  34.62 
 
 
297 aa  53.9  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  31.21 
 
 
277 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  25.57 
 
 
253 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  29.94 
 
 
272 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  35.29 
 
 
182 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0923  exonuclease-like protein  22.82 
 
 
301 aa  47.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000308008  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  30.64 
 
 
281 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  25.29 
 
 
250 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  26.22 
 
 
250 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  28.9 
 
 
168 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  26.55 
 
 
165 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  26.55 
 
 
165 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>