39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3025 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  1023    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  60.78 
 
 
505 aa  624  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  47.27 
 
 
488 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  48.19 
 
 
488 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  44.66 
 
 
529 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  44.37 
 
 
535 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  43.7 
 
 
487 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  43.76 
 
 
528 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  39.78 
 
 
461 aa  322  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  38.22 
 
 
463 aa  316  7e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  39.66 
 
 
473 aa  311  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  40.1 
 
 
464 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  36.63 
 
 
461 aa  261  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  35.91 
 
 
455 aa  259  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  35.84 
 
 
456 aa  258  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  31.07 
 
 
511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  29.39 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  31.06 
 
 
496 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  29.83 
 
 
442 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  26.67 
 
 
417 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  27.16 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  26.91 
 
 
446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  28.71 
 
 
413 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  28.33 
 
 
407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  26.89 
 
 
418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  23.73 
 
 
425 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  33.48 
 
 
436 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  25.33 
 
 
570 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  25.33 
 
 
570 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  25.33 
 
 
570 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  37.17 
 
 
580 aa  67.4  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  23.67 
 
 
559 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  23.81 
 
 
615 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  26.59 
 
 
566 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.66 
 
 
729 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  25.45 
 
 
1601 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  26.59 
 
 
566 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  25.54 
 
 
571 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  26.07 
 
 
658 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>