257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2465 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2465  NUDIX hydrolase  100 
 
 
288 aa  587  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.316655 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  40.53 
 
 
220 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0115  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
191 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
200 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  41.71 
 
 
199 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 
195 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
195 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
195 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  39.22 
 
 
202 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
195 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
211 aa  99  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
195 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  37.87 
 
 
221 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  37.81 
 
 
216 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
207 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  36.75 
 
 
195 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2273  putative NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
211 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.20194  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  34 
 
 
216 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
216 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38.55 
 
 
267 aa  95.9  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1194  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
221 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.860148  normal  0.422003 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 
189 aa  95.5  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
194 aa  95.5  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1378  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
225 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.441727  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  39.13 
 
 
285 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
197 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  37.11 
 
 
168 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1297  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
214 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2574  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
195 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.595154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  37.93 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  37.11 
 
 
168 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
226 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0918  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
221 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
226 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
227 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
198 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  35.45 
 
 
238 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  36.84 
 
 
195 aa  92.4  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
207 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3249  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
221 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
210 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
199 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
189 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
197 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 
228 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
228 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
228 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.77 
 
 
483 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
223 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.77 
 
 
427 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.77 
 
 
427 aa  89.4  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.77 
 
 
333 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  36.77 
 
 
191 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.77 
 
 
199 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.77 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  39.77 
 
 
217 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  32.3 
 
 
202 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0694  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
214 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.496821  normal  0.528067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
242 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  36.18 
 
 
203 aa  86.7  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.48 
 
 
197 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.6 
 
 
347 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 
245 aa  85.5  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1265  NUDIX hydrolase  34 
 
 
183 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.34 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2890  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 
199 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1991  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  34.87 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
198 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
193 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2973  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233103  normal  0.0737984 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  37.04 
 
 
202 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1199  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
178 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2809  hypothetical protein  34.97 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  37.43 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  36.18 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  34.56 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  31.67 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  34.56 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  34.56 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  33.75 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>