More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0492 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0492  competence/damage-inducible protein cinA  100 
 
 		 382 aa  769    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  50.92 
 
 		 430 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  41.72 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  32.98 
 
 		 420 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  49.69 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  47.8 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  46.29 
 
 		 413 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2530  competence/damage-inducible protein CinA  45.68 
 
 		 424 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  46.58 
 
 		 418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  45.56 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0608  competence/damage-inducible domain-containing protein  38.01 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000534602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  48.43 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  41.72 
 
 		 159 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  44.63 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2140  competence/damage-inducible protein cinA  40.1 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  32.78 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  44.24 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  51.66 
 
 		 162 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0300  competence/damage-inducible protein CinA  45.34 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00640906  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  38.58 
 
 		 415 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  31.12 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  43.72 
 
 		 447 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  43.83 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  43.83 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  43.83 
 
 		 421 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1923  CinA-like  50.97 
 
 		 167 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.150163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1767  hypothetical protein  43.51 
 
 		 164 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  47.53 
 
 		 203 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  43.79 
 
 		 203 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  40.94 
 
 		 166 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.8 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0243  CinA domain-containing protein  52.11 
 
 		 178 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.912222  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  38.83 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  31.14 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1767  hypothetical protein  44.23 
 
 		 164 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  45.57 
 
 		 206 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0902  competence damage-inducible protein A  46.21 
 
 		 184 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  46.21 
 
 		 162 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0143  competence-damaged protein  38.89 
 
 		 423 aa  117  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.816371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  46.21 
 
 		 162 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  47.77 
 
 		 202 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  42.68 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  50.35 
 
 		 168 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  43.62 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  43.62 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  42.95 
 
 		 168 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  47.22 
 
 		 166 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2130  competence-damage associated protein  45.81 
 
 		 168 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3947  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388392  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  46.1 
 
 		 208 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  44.59 
 
 		 208 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  36.93 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  44.3 
 
 		 165 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  47.1 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  44.3 
 
 		 165 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  41.88 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1982  competence-damaged protein  44.1 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0539323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  47.1 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  46.5 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  44.3 
 
 		 165 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  42.59 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  35.43 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  40.91 
 
 		 160 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  40 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  47.92 
 
 		 166 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  39.49 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2329  competence/damage-inducible protein CinA  41.98 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  43.31 
 
 		 208 aa  113  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0221  CinA domain-containing protein  44.16 
 
 		 164 aa  113  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  37.71 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  36.36 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  40.34 
 
 		 416 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3016  competence damage-inducible protein A  43.62 
 
 		 165 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.047861  decreased coverage  0.0000000741829 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  46.53 
 
 		 184 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  46.53 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0852  CinA domain protein  35.2 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.168381  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  45.45 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  41.67 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3177  competence damage-inducible protein A  42.28 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.266216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  51.08 
 
 		 175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  45.45 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  45.45 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  41.51 
 
 		 172 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0814  competence/damage-inducible protein CinA  39.43 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  40.11 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0198  competence/damage-inducible protein CinA  35.45 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.045921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  46.67 
 
 		 173 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3682  competence/damage-inducible protein CinA  38.99 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0279  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.31 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2068  CinA domain-containing protein  45.64 
 
 		 163 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  41.33 
 
 		 160 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  46.81 
 
 		 165 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  35.29 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>