70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0932 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1014  hypothetical protein  94.57 
 
 		 350 aa  653    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0932  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  707    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1667  hypothetical protein  96 
 
 		 350 aa  657    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1204  hypothetical protein  78.03 
 
 		 354 aa  566  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1157  hypothetical protein  71.14 
 
 		 351 aa  503  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00693475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  28.03 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  24.79 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  24.79 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  23.67 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  24.19 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  23.65 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  24.42 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  24.07 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  25.1 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  21.72 
 
 		 351 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  24.09 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  20.75 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  22.06 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  32.82 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  26.21 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  20.9 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  28.16 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  24.84 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  23.72 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  24.22 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  23.87 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  24.84 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  23.47 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  26.01 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  26.44 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 515 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  25 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  23.83 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  22.99 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  26.44 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  27.98 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  25.43 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  26.44 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  26.75 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  22.33 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.81 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  27.75 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  28.57 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  23.33 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  25.95 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  23.15 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.49 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  28.48 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  28.48 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  26.29 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  29.9 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  20.15 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  23.29 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  26.84 
 
 		 340 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  26.44 
 
 		 333 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  25.86 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  22.14 
 
 		 339 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  22.59 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  27.78 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  27.78 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  20.37 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  24.86 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  21.51 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  25.99 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>