More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1997 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 
215 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 
212 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 
214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  48.57 
 
 
215 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  44.08 
 
 
215 aa  205  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  47.37 
 
 
212 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 
216 aa  201  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  48.11 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  45.93 
 
 
212 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  49.29 
 
 
222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  48.84 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  47.44 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  48.84 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  52.11 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 
219 aa  194  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  47.91 
 
 
216 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  48.57 
 
 
213 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  46.45 
 
 
213 aa  191  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  47.17 
 
 
212 aa  191  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  46.23 
 
 
215 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 
217 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  46.23 
 
 
214 aa  188  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  53.08 
 
 
210 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 
213 aa  188  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  46.7 
 
 
215 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 
215 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  43.72 
 
 
216 aa  187  9e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  46.6 
 
 
210 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  45.71 
 
 
217 aa  185  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  46.86 
 
 
210 aa  185  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  44.81 
 
 
214 aa  184  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  48.11 
 
 
210 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  51.17 
 
 
220 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3549  maleylacetoacetate isomerase  49.28 
 
 
211 aa  184  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  45.75 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  46.05 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  44.33 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  46.7 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  39.61 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  42.72 
 
 
216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  43.6 
 
 
212 aa  181  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  47.09 
 
 
213 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 
214 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 
214 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 
214 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  45.58 
 
 
216 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  44.08 
 
 
216 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  45.58 
 
 
216 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  42.25 
 
 
214 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  44.91 
 
 
215 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  45.58 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  42.47 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  42.92 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  42.92 
 
 
229 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  47.06 
 
 
206 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 
211 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  46.7 
 
 
210 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  38.65 
 
 
212 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  46.45 
 
 
220 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  42.4 
 
 
222 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  44.91 
 
 
216 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  45.75 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  40.28 
 
 
212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  45.54 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  44.66 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  41.51 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 
214 aa  171  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  44.75 
 
 
221 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  43.72 
 
 
216 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  43.98 
 
 
212 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  42.33 
 
 
216 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  44.34 
 
 
210 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  42.66 
 
 
220 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  41.1 
 
 
222 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 
212 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  41.82 
 
 
222 aa  167  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 
218 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  43.59 
 
 
210 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  40 
 
 
221 aa  166  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  42.58 
 
 
214 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  42.58 
 
 
214 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3570  maleylacetoacetate isomerase  47.93 
 
 
220 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3502  maleylacetoacetate isomerase  47.93 
 
 
220 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 
230 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  44.5 
 
 
214 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  42.58 
 
 
214 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  45.28 
 
 
212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  44.44 
 
 
212 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  44.5 
 
 
214 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 
214 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 
214 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  39.62 
 
 
214 aa  165  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 
214 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 
214 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  42.58 
 
 
214 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  41.4 
 
 
216 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  41.43 
 
 
213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  44.5 
 
 
222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  42.11 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>