More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3549 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3549  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  55.98 
 
 		 213 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  54.81 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  51.44 
 
 		 210 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  53.4 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  52.22 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  49.28 
 
 		 215 aa  195  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  49.28 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2626  maleylacetoacetate isomerase  55.84 
 
 		 215 aa  194  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.503321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  49.53 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  48.78 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  49.26 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  53.11 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  49.29 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  49.28 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  51.47 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  48.53 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  49.29 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  51.21 
 
 		 217 aa  184  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  49.29 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  48.34 
 
 		 216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  46.86 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  49.29 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  49.29 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  46.86 
 
 		 214 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  45.75 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  48.82 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  48.04 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  50.53 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  44.44 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  44.88 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  47.09 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  47.09 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  43.41 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  47.12 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  47.09 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  49.47 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  43.72 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  49.27 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  45.37 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  48.94 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  47.34 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  43.41 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  47.55 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3570  maleylacetoacetate isomerase  48.34 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  48.58 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  48.4 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3502  maleylacetoacetate isomerase  48.34 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  45.81 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  45.37 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  44.66 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  44.66 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  44.66 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  49.31 
 
 		 222 aa  164  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  43.43 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  44.55 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  49.31 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  45.89 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  46.34 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  45.32 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3421  maleylacetoacetate isomerase  47.87 
 
 		 220 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  46.38 
 
 		 220 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  44.08 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  41.59 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  49.76 
 
 		 210 aa  161  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  45.67 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  46.6 
 
 		 211 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 		 216 aa  160  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  43.33 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  44.17 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  40.95 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  45.1 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  42.11 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  46.83 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  42.52 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50200  maleylacetoacetate isomerase  54.29 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  40.95 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  44.13 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  44.44 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  42.31 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  47.45 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  46.34 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  44.23 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  45.63 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  44.17 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  44.66 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  46.34 
 
 		 212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  43.69 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  43.69 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  44.81 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  44.66 
 
 		 213 aa  154  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.716277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>