More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2626 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2626  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.503321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2831  maleylacetoacetate isomerase  56.34 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 210 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3549  maleylacetoacetate isomerase  54.21 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  45.83 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  46.76 
 
 		 222 aa  171  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  46.19 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  47.24 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  44.19 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  47.57 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  46.05 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  45.97 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  41.55 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  42.92 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 217 aa  161  9e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  42.4 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  46.05 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  41.47 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  41.47 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  45.89 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  40.98 
 
 		 212 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  41.63 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  41.01 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  41.47 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  41.67 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  43.32 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  41.01 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  43.26 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  43 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  43.75 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  43.2 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  39.72 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  41.4 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  42.31 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  44.81 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  37.62 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  38.1 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  39.05 
 
 		 216 aa  148  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  43.13 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  41.46 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  41.04 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  41.06 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  41.06 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  39.53 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3421  maleylacetoacetate isomerase  44.08 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  42.35 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  39.11 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  40.09 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  44.86 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  40.87 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3570  maleylacetoacetate isomerase  42.65 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  41.83 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  40.87 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3502  maleylacetoacetate isomerase  42.65 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  38.16 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  40.55 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  41.55 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  41.04 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  41.83 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  41.83 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  38.68 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  41.83 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  39.63 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  40.28 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  37.07 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  37.68 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  40.28 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  40.27 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  40.1 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  41.35 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  40 
 
 		 213 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  40 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  38.36 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  42.86 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  42.51 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  36.67 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  40 
 
 		 214 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3679  maleylacetoacetate isomerase  43.69 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.384029  normal  0.429987 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  37.61 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  39.51 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  38.76 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  41.75 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  37.67 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  41.95 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2629  maleylacetoacetate isomerase  40.38 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000227803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4524  putative maleylpyruvate isomerase (MhbI)  40.38 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  41.06 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  41.83 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  42.03 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  43.75 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2762  maleylacetoacetate isomerase  42.23 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  46.52 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>