238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_08460 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_08460  tRNA-Leu  100 
 
 
81 bp  161  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0705236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0049  tRNA-Leu  93.9 
 
 
85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.623993  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0053  tRNA-Leu  93.9 
 
 
85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0708883  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0061  tRNA-Leu  93.9 
 
 
85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.489102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0051  tRNA-Leu  93.9 
 
 
85 bp  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  91.46 
 
 
85 bp  99.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0048  tRNA-Leu  91.46 
 
 
85 bp  99.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.624734  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0092  tRNA-Leu  91.46 
 
 
85 bp  99.6  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.32054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0081  tRNA-Leu  91.46 
 
 
85 bp  99.6  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0012  tRNA-Leu  91.46 
 
 
85 bp  99.6  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA41  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0905521  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0038    97.83 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.781557  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0033  tRNA-Leu  97.83 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0032  tRNA-Leu  97.83 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0029  tRNA-Leu  97.83 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.316584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0039  tRNA-Leu  97.83 
 
 
85 bp  83.8  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0647053  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20010  tRNA-Leu  91.3 
 
 
82 bp  81.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.108491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0026  tRNA-Leu  91.3 
 
 
82 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0024  tRNA-Leu  91.3 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.348047  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0030  tRNA-Leu  91.3 
 
 
85 bp  81.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  95.83 
 
 
81 bp  79.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0010  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  79.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0047  tRNA-Leu  88.1 
 
 
85 bp  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0028  tRNA-Leu  95.65 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0008  tRNA-Leu  87.8 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.429157  normal  0.0709893 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1859  tRNA-Leu  95.65 
 
 
82 bp  75.8  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0041  tRNA-Leu  97.62 
 
 
85 bp  75.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0554879  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0024  tRNA-Leu  89.23 
 
 
84 bp  73.8  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  97.5 
 
 
85 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0022  tRNA-Leu  86.75 
 
 
86 bp  71.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000969844  normal  0.805987 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1215  tRNA-Leu  97.44 
 
 
87 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0750  tRNA-Leu  97.44 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0310097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0027  tRNA-Leu  97.44 
 
 
85 bp  69.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.985368  normal  0.200865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3563  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3566  tRNA-Leu  97.37 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0037  tRNA-Leu  95.24 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17364  normal  0.432753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0027  tRNA-Leu  93.48 
 
 
85 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000026445  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  88.41 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  88.41 
 
 
85 bp  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0040  tRNA-Leu  91.67 
 
 
81 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0014  tRNA-Leu  95 
 
 
82 bp  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0024  tRNA-Leu  91.67 
 
 
81 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0705568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0032  tRNA-Leu  95 
 
 
83 bp  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0014  tRNA-Leu  95 
 
 
87 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.654182  normal  0.6782 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0007  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNALeuVIMSS1309276  tRNA-Leu  88.06 
 
 
82 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0005  tRNA-Leu  85.92 
 
 
84 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt22  tRNA-Leu  94.74 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt22  tRNA-Leu  94.74 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0009  tRNA-Leu  94.74 
 
 
84 bp  60  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0034  tRNA-Leu  94.74 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.880113  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2213  tRNA-Leu  94.74 
 
 
87 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  94.74 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0050  tRNA-Leu  91.3 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00562021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0039  tRNA-Leu  94.74 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00489607  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0111  tRNA-Leu  91.3 
 
 
85 bp  60  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  94.74 
 
 
83 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00820  tRNA-Leu  85.92 
 
 
87 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0503548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0036  tRNA-Leu  94.59 
 
 
85 bp  58  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0003  tRNA-Leu  87.14 
 
 
86 bp  56  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.589576  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0039  tRNA-Leu  92.5 
 
 
87 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0003  tRNA-Leu  87.14 
 
 
86 bp  56  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  92.5 
 
 
82 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0003  tRNA-Leu  87.14 
 
 
83 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  85 
 
 
85 bp  56  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  92.5 
 
 
82 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0445  tRNA-Leu  94.44 
 
 
85 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0460739  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1580  tRNA-Leu  86.11 
 
 
85 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1615  tRNA-Leu  86.11 
 
 
85 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.622416 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07707  tRNA-Leu  100 
 
 
82 bp  56  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.650845  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0003  tRNA-Leu  87.14 
 
 
83 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.012184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0003  tRNA-Leu  87.14 
 
 
83 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0043  tRNA-Leu  92.5 
 
 
85 bp  56  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187208  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0003  tRNA-Leu  87.14 
 
 
83 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.98053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0002  tRNA-Leu  87.14 
 
 
83 bp  56  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.867688  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  92.5 
 
 
82 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14003  tRNA-Leu  87.14 
 
 
86 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0031  tRNA-Leu  92.31 
 
 
83 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0042  tRNA-Leu  92.31 
 
 
82 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALeuVIMSS1309360  tRNA-Leu  92.31 
 
 
85 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0012  tRNA-Leu  84.51 
 
 
84 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0064  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0042  tRNA-Leu  94.29 
 
 
82 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105612  normal  0.123579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  94.29 
 
 
85 bp  54  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALeuVIMSS1309184  tRNA-Leu  92.31 
 
 
83 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0019  tRNA-Leu  96.77 
 
 
87 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.819942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0006  tRNA-Leu  92.11 
 
 
84 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0901728  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1187  tRNA-Leu  92.11 
 
 
87 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0016  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57692  normal  0.238964 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t19  tRNA-Leu  100 
 
 
88 bp  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0031  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000305297  normal  0.643449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0071  tRNA-Leu  100 
 
 
85 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690951  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0029  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0171739  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1365  tRNA-Leu  92.86 
 
 
84 bp  52  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0033  tRNA-Leu  90.48 
 
 
87 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0024  tRNA-Leu  100 
 
 
87 bp  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0070  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436303  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0073  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.218287  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0094  tRNA-Leu  94.12 
 
 
85 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>