24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2157 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2157  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.609376  normal  0.0292686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4866  putative lipoprotein  38.89 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0643  hypothetical protein  34.35 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55850  putative pilus assembly protein  39.89 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0843  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1662  tetratricopeptide TPR_2  29.95 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.061862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1637  hypothetical protein  30.69 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.735654  normal  0.200173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4856  TPR domain protein  30.77 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4396  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.29 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2067  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.457723  normal  0.512607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1408  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2321  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.49 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2699  lipoprotein, putative  27.49 
 
 		 279 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3659  flp pilus assembly protein  24.35 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.78139  normal  0.265077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4450  Tetratricopeptide domain protein  33.57 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1658  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02589  lipoprotein transmembrane  28.25 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.600145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1448  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 870 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2793  putative lipoprotein transmembrane  30.71 
 
 		 284 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.184399  normal  0.585229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>