More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2140 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2140  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0354411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3440  glutamine ABC transporter permease protein  52.29 
 
 
218 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0865  glutamine ABC transporter permease protein  53.42 
 
 
219 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.813603  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0956  glutamine ABC transporter permease protein  53.42 
 
 
219 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0688555  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0977  glutamine ABC transporter permease protein  53.42 
 
 
219 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.034777  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0924  glutamine ABC transporter permease protein  53.42 
 
 
219 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0141353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0893  glutamine ABC transporter permease protein  53.42 
 
 
219 aa  231  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110521  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1297  glutamine ABC transporter permease protein  52.51 
 
 
219 aa  231  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00777  glutamine ABC transporter permease protein  52.97 
 
 
219 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2832  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.97 
 
 
219 aa  230  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.137324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0879  glutamine ABC transporter permease protein  52.97 
 
 
219 aa  230  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00794  hypothetical protein  52.97 
 
 
219 aa  230  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0959  glutamine ABC transporter permease protein  52.97 
 
 
219 aa  230  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000482918  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0866  glutamine ABC transporter permease protein  52.97 
 
 
219 aa  230  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178122  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2833  glutamine ABC transporter permease protein  52.97 
 
 
219 aa  230  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.2982  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2538  glutamine ABC transporter permease protein  53.42 
 
 
219 aa  230  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000998158  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0834  glutamine ABC transporter permease protein  52.97 
 
 
219 aa  230  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000546906  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4283  glutamine ABC transporter permease protein  51.83 
 
 
235 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4083  glutamine ABC transporter permease protein  51.83 
 
 
235 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292626  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1960  glutamine ABC transporter permease protein  50.92 
 
 
218 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120832  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2097  glutamine ABC transporter permease protein  50 
 
 
218 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0754215  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1486  glutamine ABC transporter permease protein  50 
 
 
218 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1405  glutamine ABC transporter permease protein  49.54 
 
 
235 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2390  glutamine ABC transporter permease protein  49.54 
 
 
235 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1125  glutamine ABC transporter permease protein  49.54 
 
 
235 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3157  glutamine ABC transporter permease protein  49.54 
 
 
235 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0481708  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3271  glutamine ABC transporter permease protein  49.54 
 
 
235 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835494  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2356  glutamine ABC transporter permease protein  50 
 
 
230 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3698  glutamine ABC transporter permease protein  52.75 
 
 
218 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1155  glutamine ABC transporter permease protein  50.92 
 
 
218 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2879  glutamine ABC transporter permease protein  49.32 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0618158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1707  glutamine ABC transporter permease protein  50.46 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.165583  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1478  glutamine ABC transporter permease protein  51.14 
 
 
219 aa  207  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2489  glutamine ABC transporter permease protein  51.6 
 
 
219 aa  205  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0167  amino acid ABC transporter permease  46.51 
 
 
251 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1599  glutamine ABC transporter permease protein  49.54 
 
 
218 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1774  glutamine ABC transporter permease protein  49.54 
 
 
218 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000313733  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1494  glutamine ABC transporter permease protein  49.54 
 
 
218 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0612957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
227 aa  198  5e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.91 
 
 
223 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1583  glutamine ABC transporter permease protein  49.32 
 
 
219 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2392  glutamine ABC transporter permease protein  47.49 
 
 
219 aa  185  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.303951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2856  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  48.11 
 
 
223 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2368  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 
226 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3046  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.28 
 
 
237 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156389  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3297  amino acid ABC transporter permease  42.72 
 
 
223 aa  168  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1136  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.12 
 
 
235 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.199048  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.9 
 
 
216 aa  158  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  41.71 
 
 
216 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0728  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 
221 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.39 
 
 
492 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1127  amino acid ABC transporter permease  36.4 
 
 
237 aa  151  7e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1376  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.26 
 
 
223 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000031441  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4903  putative amino acid ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 
230 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.66 
 
 
233 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1941  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
220 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00173617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
493 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3951  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
221 aa  148  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.365778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0415  putative amino acid ABC transporter, permease protein  38.89 
 
 
230 aa  147  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1474  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.55 
 
 
226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190453  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2234  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0725  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.164359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.28 
 
 
216 aa  145  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  37.91 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 
216 aa  144  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1230  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
226 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0352  amino acid ABC transproter, permease  39.81 
 
 
291 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.02 
 
 
224 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5743  putative amino acid ABC transporter permease  39.81 
 
 
269 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
216 aa  141  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0162  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.9 
 
 
222 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0136  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  36.92 
 
 
516 aa  141  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000337877  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0742  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3743  amino acid ABC transporter permease  37.21 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.870157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0219509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.65 
 
 
218 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0338  amino acid ABC transport system, permease  39.35 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0145734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1039  amino acid ABC transporter permease  36.2 
 
 
222 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  0.0386437 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.77 
 
 
230 aa  138  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0751  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  33.65 
 
 
545 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0389728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2297  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.69 
 
 
252 aa  136  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4224  amino acid ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
219 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000683545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0608  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
218 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4284  amino acid ABC transporter, permease protein  34.26 
 
 
219 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000456924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0552  glutamine ABC transporter permease  33.18 
 
 
218 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2304  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.48 
 
 
265 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000299227  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3584  amino acid ABC transporter permease  38.86 
 
 
223 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.495139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  38.43 
 
 
501 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0641  amino acid ABC transporter permease  33.18 
 
 
218 aa  136  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00751047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0698  amino acid ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 
218 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0214  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  34.27 
 
 
516 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.002492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3994  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0526601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
513 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0347  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.95 
 
 
230 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1595  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
271 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.500436  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0226  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.79 
 
 
222 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4173  amino acid ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 
219 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.126592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4058  amino acid ABC transporter permease  33.8 
 
 
219 aa  135  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3897  amino acid ABC transporter, permease  33.8 
 
 
219 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.09435e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>