188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1599 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1599  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 500 aa  965    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0656  GTP-binding protein HSR1-related protein  60.89 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.53051  normal  0.190619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  28.34 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  27.7 
 
 		 614 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4133  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.49 
 
 		 840 aa  98.2  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  25.74 
 
 		 637 aa  97.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  28.99 
 
 		 629 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  26.45 
 
 		 650 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  27.79 
 
 		 635 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  38.82 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  23.98 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  23.98 
 
 		 296 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  30.16 
 
 		 303 aa  53.9  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  30 
 
 		 299 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  30.73 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3535  GTP-binding protein Era  26.19 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  31.06 
 
 		 300 aa  51.2  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  35.23 
 
 		 297 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  28.99 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  27.61 
 
 		 445 aa  50.1  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1616  GTP-binding protein EngA  31.54 
 
 		 471 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207628  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1598  GTP-binding protein EngA  28.31 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111864  normal  0.122269 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1830  GTP-binding protein EngA  33.02 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1060  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 289 aa  49.7  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00411947  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1341  GTP-binding protein EngA  33.02 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2350  GTP-binding protein EngA  33.02 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  32.61 
 
 		 308 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2238  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 445 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.746998  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1543  GTP-binding protein Era  27.66 
 
 		 314 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3772  hypothetical protein  31.17 
 
 		 350 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000473871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0066  GTP-binding protein EngA  33.02 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.225046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2185  GTP-binding protein EngA  33.02 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2223  GTP-binding protein EngA  33.02 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1102  GTP-binding protein EngA  33.02 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.90536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  31.5 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2537  GTP-binding protein EngA  34.94 
 
 		 445 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358302  hitchhiker  0.0000595621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  26.67 
 
 		 300 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  33.58 
 
 		 298 aa  49.3  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0296  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2082  GTP-binding protein EngA  32.04 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 298 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1497  small GTP-binding protein  34.21 
 
 		 476 aa  48.5  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  27.82 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  25.97 
 
 		 296 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  37.18 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0593  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 354 aa  48.5  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  29.45 
 
 		 567 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0861  GTP-binding protein Era  33.82 
 
 		 353 aa  48.5  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  37.66 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  31.88 
 
 		 298 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  35.92 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  31.25 
 
 		 437 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  34.44 
 
 		 465 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  31.07 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  31.88 
 
 		 298 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0842  GTP-binding protein Era  29.95 
 
 		 287 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0615921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17220  GTP-binding protein Era  33.59 
 
 		 313 aa  47.4  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00402768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  35.16 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  28.47 
 
 		 306 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  37.08 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2373  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 466 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  32.09 
 
 		 296 aa  47  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  28.03 
 
 		 301 aa  47  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1946  GTP-binding protein Era  29.93 
 
 		 303 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  33.33 
 
 		 484 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2102  GTP-binding protein EngA  31.07 
 
 		 447 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0508209  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  28 
 
 		 313 aa  47  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0887  GTP-binding protein EngA  28.79 
 
 		 487 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1287  GTP-binding protein EngA  38.04 
 
 		 454 aa  47  0.0009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.720297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  31.43 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  26.96 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1369  GTP-binding protein EngA  36.89 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.911808  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  28.12 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1752  GTP-binding protein Era  38.2 
 
 		 312 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.389985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  28.78 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1210  GTP-binding protein EngA  30.08 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1719  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  37.04 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6542  small GTP-binding protein  27.64 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  25.44 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1825  GTP-binding protein Era  29.13 
 
 		 309 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1746  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  34.21 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 		 445 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2599  tRNA modification GTPase TrmE  32.81 
 
 		 470 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.652843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1743  GTP-binding protein Era  25.95 
 
 		 293 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0418  GTP-binding protein Era  24.29 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1131  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  28.78 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  42.86 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1223  GTP-binding protein Era  27.91 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  36.56 
 
 		 438 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  26.95 
 
 		 436 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  43.24 
 
 		 758 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1561  Era, Era/TrmE family GTP-binding protein  27.13 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.400098  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0668  GTP-binding protein EngA  36.96 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>