28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0639 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  100 
 
 
848 aa  1738    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  24.34 
 
 
866 aa  108  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2965  hypothetical protein  35.43 
 
 
440 aa  93.2  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3173  hypothetical protein  33.84 
 
 
417 aa  89.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3238  hypothetical protein  25.47 
 
 
947 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0772641  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  24.39 
 
 
509 aa  85.5  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2603  hypothetical protein  22.49 
 
 
517 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4210  hypothetical protein  40.74 
 
 
353 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1690  hypothetical protein  31.77 
 
 
370 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03960  hypothetical protein  24.39 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.23056  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6725  hypothetical protein  36.42 
 
 
759 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.453988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1647  hypothetical protein  28.74 
 
 
851 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  26.17 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  24.22 
 
 
813 aa  74.7  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  23.56 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  23.72 
 
 
458 aa  73.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  25.98 
 
 
542 aa  73.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  29.65 
 
 
857 aa  65.1  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  21.93 
 
 
815 aa  58.2  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  24.48 
 
 
621 aa  49.3  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  24.8 
 
 
718 aa  48.9  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  23.11 
 
 
515 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  22.85 
 
 
616 aa  46.2  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5574  Primase 2  22.07 
 
 
1287 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1589  hypothetical protein  29.82 
 
 
187 aa  45.4  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.159507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  24.83 
 
 
542 aa  45.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3980  hypothetical protein  29.76 
 
 
728 aa  44.3  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0426  phage DNA-polymerase or DNA-primase  26.7 
 
 
303 aa  44.3  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>