More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1809 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1743  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
518 aa  1036    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718943  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1762  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
518 aa  1036    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.955756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1809  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
518 aa  1036    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.318036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4363  AMP-dependent synthetase and ligase  62.88 
 
 
515 aa  631  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1981  AMP-dependent synthetase and ligase  63.62 
 
 
521 aa  620  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 
522 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0183193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1761  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 
522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 
522 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  39.39 
 
 
500 aa  274  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2960  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 
513 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.958907  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2711  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 
539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2666  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 
539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2696  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 
539 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4364  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 
500 aa  260  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3245  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 
519 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0034073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5429  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
525 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  31.58 
 
 
549 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  31.38 
 
 
549 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 
549 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  32.66 
 
 
552 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  33.86 
 
 
550 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.84 
 
 
552 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  30.98 
 
 
550 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  31.73 
 
 
549 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0355  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
559 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476101  hitchhiker  0.000011609 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  31.23 
 
 
547 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0324  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
581 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.235527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.53 
 
 
549 aa  220  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 
540 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 
558 aa  219  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.42 
 
 
549 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.95 
 
 
544 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  31.24 
 
 
552 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  31.03 
 
 
552 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
566 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 
538 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  30.97 
 
 
560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  32.56 
 
 
538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 
554 aa  213  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  32.82 
 
 
540 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  32.82 
 
 
540 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 
576 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4634  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 
557 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.29 
 
 
518 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 
563 aa  209  9e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
843 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  33.67 
 
 
576 aa  208  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 
553 aa  207  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
558 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  30.93 
 
 
568 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
1043 aa  206  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
566 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  30.04 
 
 
548 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  30.48 
 
 
572 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  33.67 
 
 
570 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  33.67 
 
 
576 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  33.67 
 
 
576 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  33.67 
 
 
576 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  33.67 
 
 
576 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  33.67 
 
 
576 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 
566 aa  204  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  33.67 
 
 
576 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  33.6 
 
 
575 aa  203  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  32.79 
 
 
547 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.47 
 
 
828 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  32.22 
 
 
575 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  32.22 
 
 
575 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  32.45 
 
 
539 aa  200  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 
571 aa  199  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  31.08 
 
 
560 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  32.05 
 
 
576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  31.21 
 
 
576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  30.4 
 
 
549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
499 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  31.47 
 
 
575 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2746  putative long chain fatty acid CoA ligase  30.86 
 
 
543 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 
528 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.15 
 
 
605 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0851693  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7124  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 
540 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  31.71 
 
 
561 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.47 
 
 
514 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
545 aa  195  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  32.48 
 
 
546 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  31.79 
 
 
564 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  29 
 
 
548 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 
587 aa  195  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 
544 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
566 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
630 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  31.26 
 
 
562 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  30.75 
 
 
557 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  30.68 
 
 
560 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  27.38 
 
 
596 aa  193  8e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  31.6 
 
 
557 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  31.08 
 
 
546 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.72 
 
 
579 aa  192  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
525 aa  192  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  31.08 
 
 
546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 
575 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  31.27 
 
 
546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>