More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1266 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  71.24 
 
 
467 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  78.68 
 
 
471 aa  707    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
470 aa  934    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
470 aa  934    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  90.02 
 
 
495 aa  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  99.57 
 
 
470 aa  931    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  88.91 
 
 
471 aa  810    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  71.67 
 
 
467 aa  630  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  69.03 
 
 
467 aa  623  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  68.74 
 
 
467 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  61.83 
 
 
470 aa  567  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  61.72 
 
 
467 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  62.85 
 
 
468 aa  555  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  64.45 
 
 
467 aa  538  9.999999999999999e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  60.61 
 
 
463 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  59 
 
 
463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.91 
 
 
464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  57.6 
 
 
481 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  59.1 
 
 
460 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  57.02 
 
 
465 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  56.19 
 
 
493 aa  495  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  57.8 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  54.8 
 
 
479 aa  493  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  57.14 
 
 
483 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  55.82 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  54.18 
 
 
471 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  58.91 
 
 
463 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  53.1 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  53.41 
 
 
471 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  53.32 
 
 
478 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  54.84 
 
 
478 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  52.38 
 
 
506 aa  433  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  50.84 
 
 
491 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  55.04 
 
 
495 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  51.06 
 
 
468 aa  422  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  55.48 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.53 
 
 
470 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
471 aa  227  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
468 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
458 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 
465 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.17 
 
 
463 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.69 
 
 
458 aa  217  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.53 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  28.67 
 
 
473 aa  212  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
459 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.2 
 
 
465 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.89 
 
 
459 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.67 
 
 
459 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.89 
 
 
459 aa  211  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.41 
 
 
585 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.32 
 
 
616 aa  210  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.28 
 
 
465 aa  209  6e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.45 
 
 
470 aa  210  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.05 
 
 
459 aa  209  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.36 
 
 
459 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.82 
 
 
459 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.45 
 
 
464 aa  208  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
465 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.1 
 
 
468 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 
462 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.79 
 
 
465 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.83 
 
 
480 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.09 
 
 
473 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.45 
 
 
459 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.36 
 
 
480 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.4 
 
 
473 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.37 
 
 
459 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.61 
 
 
480 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.81 
 
 
479 aa  202  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.29 
 
 
489 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.16 
 
 
474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.74 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.69 
 
 
468 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
462 aa  199  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.07 
 
 
462 aa  199  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.54 
 
 
468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.06 
 
 
481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
454 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.64 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 
468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.37 
 
 
470 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.21 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.93 
 
 
463 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.42 
 
 
491 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.83 
 
 
469 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 
466 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 
466 aa  196  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
470 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.25 
 
 
479 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
470 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 
468 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.76 
 
 
466 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 
459 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
470 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.22 
 
 
466 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>