More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4908 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_1185  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  91.62 
 
 
378 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1195  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  91.36 
 
 
378 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0467691 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1512  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  92.13 
 
 
378 aa  685    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33643  normal  0.738948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1168  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  91.62 
 
 
378 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.670905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4908  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
382 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13444  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  87.83 
 
 
375 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0996238  normal  0.0971856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1727  IMP dehydrogenase family protein  77.55 
 
 
385 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.594141  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0907  IMP dehydrogenase family protein  72.87 
 
 
388 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6534  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  67.37 
 
 
377 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04750  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  66.32 
 
 
377 aa  475  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1247  IMP dehydrogenase family protein  62.23 
 
 
375 aa  408  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.286643  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4226  IMP dehydrogenase family protein  58.06 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.311533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4446  IMP dehydrogenase family protein  57.89 
 
 
383 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.769134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0624  IMP dehydrogenase family protein  55.05 
 
 
372 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3836  IMP dehydrogenase family protein  58.31 
 
 
387 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1161  IMP dehydrogenase/GMP reductase-like protein  55.59 
 
 
372 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2595  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.72 
 
 
370 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4022  IMP dehydrogenase family protein  53.46 
 
 
370 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0575021  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16500  IMP dehydrogenase family protein  52.37 
 
 
378 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.347452  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07610  IMP dehydrogenase family protein  53.23 
 
 
373 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.77961  normal  0.235896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0689  IMP dehydrogenase family protein  52.11 
 
 
374 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.525708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28640  IMP dehydrogenase family protein  52.89 
 
 
374 aa  356  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0814  IMP dehydrogenase family protein  50 
 
 
376 aa  354  1e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4252  IMP dehydrogenase family protein  52.12 
 
 
372 aa  354  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1013  IMP dehydrogenase family protein  51.72 
 
 
369 aa  349  5e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.143768 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3640  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.66 
 
 
368 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0743  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.13 
 
 
373 aa  343  2e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148651  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0399  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  49.74 
 
 
374 aa  344  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0164551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3053  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.84 
 
 
374 aa  342  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2584  IMP dehydrogenase family protein  52.37 
 
 
374 aa  338  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.359176  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5997  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.51 
 
 
376 aa  335  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1092  IMP dehydrogenase family protein  55.68 
 
 
352 aa  335  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0367  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  51.06 
 
 
369 aa  335  9e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.611854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2874  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  53.19 
 
 
378 aa  332  7.000000000000001e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00446551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2581  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.39 
 
 
378 aa  330  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0641  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.92 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.520073  normal  0.513154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0637  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  52.65 
 
 
376 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08740  IMP dehydrogenase family protein  50.81 
 
 
369 aa  299  6e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0459  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  50.27 
 
 
387 aa  297  2e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.490443  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1874  IMP dehydrogenase family protein  47.61 
 
 
396 aa  292  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31682  decreased coverage  0.00497597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0815  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  46.01 
 
 
386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11521  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1831  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.73 
 
 
387 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0836682 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11681  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.27 
 
 
387 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.819706  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11671  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
387 aa  246  6.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.83783  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1073  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.37 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0630068  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0384  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.01 
 
 
381 aa  240  2e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000205726  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_328  IMP dehydrogenase protein  38.27 
 
 
381 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000257669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.01 
 
 
381 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000405165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2653  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.83 
 
 
387 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1873  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.57 
 
 
384 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11281  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.9 
 
 
387 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0365  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.3 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0372  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.3 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.475863  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4230  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  40.43 
 
 
391 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403916 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15241  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
387 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0690  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  35.11 
 
 
387 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3501  IMP dehydrogenase family protein  37.77 
 
 
387 aa  228  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09131  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  39.05 
 
 
388 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1944  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  38.36 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0721  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  36.97 
 
 
387 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3306  IMP dehydrogenase subunit  46.88 
 
 
219 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0094959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3304  IMP dehydrogenase  36.07 
 
 
124 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008383 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0420  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  34.11 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3610  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.19 
 
 
495 aa  76.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.0328127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  32.35 
 
 
498 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.94 
 
 
498 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B16  inosine 5-monophosphate dehydrogenase  25.57 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.44 
 
 
498 aa  73.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1984  GMP reductase  23.91 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000394902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.55 
 
 
486 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3071  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.25 
 
 
497 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303181  normal  0.0977004 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.82 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.3 
 
 
498 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2213  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.37 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.6099  normal  0.441831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.11 
 
 
488 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1616  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.57 
 
 
486 aa  70.5  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0341  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  30.07 
 
 
499 aa  69.7  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.86 
 
 
496 aa  69.7  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1646  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.26 
 
 
484 aa  69.3  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.536649  hitchhiker  0.0000000511927 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0908  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.62 
 
 
485 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1471  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.76 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0143553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.09 
 
 
498 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0548  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.21 
 
 
547 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1766  IMP dehydrogenase/GMP reductase  31.88 
 
 
369 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0029  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.71 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.09 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.05 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  30.2 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.64 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.95 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.95 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.95 
 
 
504 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.48 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1152  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.6 
 
 
482 aa  67  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3045  GMP reductase  30.54 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1514  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.11 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339989  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2868  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.11 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.419057  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl343  inositol-5-monophosphate dehydrogenase  27 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000535493  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1297  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  35.59 
 
 
488 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.724136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>