87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0460 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0460  Ion transport 2 domain-containing protein  100 
 
 		 374 aa  750    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0551  Ion transport 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 367 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.43127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0775  Ion transport 2 domain-containing protein  40.12 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  27.43 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3784  potassium channel protein, putative  26.09 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2744  Ion transport 2 domain protein  24.36 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.518191  normal  0.0161017 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  22.03 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  28.93 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  24.25 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  22.77 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  24.46 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3000  Ion transport 2 domain protein  27.08 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  20.93 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5028  hypothetical protein  22.37 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.38 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4718  Ion transport 2 domain-containing protein  22.22 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0856432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  23.31 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  23.98 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.05 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  21.77 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2438  hypothetical protein  24.39 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.1503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  20.74 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  22.55 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  21.77 
 
 		 330 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  21.77 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  21.77 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0205  hypothetical protein  22.3 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000989873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  26.94 
 
 		 388 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  21.77 
 
 		 334 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  22.55 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  24.67 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5128  hypothetical protein  22.22 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4765  hypothetical protein  22.22 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4605  potassium channel protein  22.22 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5008  hypothetical protein  22.22 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.26 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5040  hypothetical protein  21.36 
 
 		 331 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00727764  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  25.9 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3507  Ion transport 2 domain-containing protein  21.84 
 
 		 331 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00681097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4627  potassium channel protein  21.36 
 
 		 331 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  20.86 
 
 		 335 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  25.25 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  26.7 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  26.7 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  22.75 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  22.58 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  22.55 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  20.54 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  21.46 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  21.03 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  23.38 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  23.38 
 
 		 350 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5035  hypothetical protein  21.36 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0193988  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  23.39 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  23.36 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  19.94 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1148  TrkA-N domain protein  24.6 
 
 		 614 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.549431 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  26.64 
 
 		 352 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  23.39 
 
 		 346 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  23.97 
 
 		 346 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0847  TrkA-N domain protein  21.89 
 
 		 359 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0205361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02186  voltage-gated ion channel superfamily protein  26.22 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  27 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5275  Ion transport 2 domain protein  23.93 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.02 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  22.66 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  24.12 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0725  Ion transport 2 domain-containing protein  30 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0347274 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  20.21 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2679  putative ion transport protein  35.42 
 
 		 253 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  24.34 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  19.49 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  23.77 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1138  TrkA-N domain protein  22.09 
 
 		 366 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4534  Ion transport 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 260 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  19.49 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4447  Ion transport 2  34.07 
 
 		 260 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0874617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  19.93 
 
 		 376 aa  43.5  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  19.49 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  19.7 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4829  Ion transport 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 260 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.700731  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04950  potassium channel, putative  28.7 
 
 		 807 aa  43.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.127919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  29.11 
 
 		 335 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  20.49 
 
 		 395 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0882  Ion transport 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 241 aa  42.7  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000375333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>