215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1283 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1283  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
234 aa  482  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0681  cobalamin synthesis protein P47K  88.79 
 
 
232 aa  441  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1275  cobalamin synthesis protein P47K  88.79 
 
 
232 aa  441  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1401  cobalamin synthesis protein, P47K  88.79 
 
 
232 aa  441  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.265062  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0155  cobalamin synthesis protein P47K  84.75 
 
 
236 aa  419  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0682  cobalamin synthesis protein, P47K  60.68 
 
 
232 aa  317  9e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1456  cobalamin synthesis protein, P47K  60.68 
 
 
232 aa  313  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0687195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1684  hypothetical protein  49.35 
 
 
230 aa  246  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0476  hypothetical protein  50.44 
 
 
238 aa  240  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1977  cobalamin synthesis protein P47K  50.66 
 
 
231 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2266  hypothetical protein  49.33 
 
 
230 aa  234  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407392  normal  0.68566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1989  cobalamin synthesis protein P47K  48 
 
 
232 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1675  hypothetical protein  47.79 
 
 
230 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1036  cobalamin synthesis protein P47K  46.9 
 
 
227 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0345  cobalamin synthesis protein, P47K  46.67 
 
 
232 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0743251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00470  nickel incorporation protein  46.02 
 
 
240 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146336  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4262  cobalamin synthesis protein P47K  44.69 
 
 
232 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000645522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2095  hypothetical protein  45.33 
 
 
227 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.142349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3327  cobalamin synthesis protein, P47K  45.13 
 
 
227 aa  215  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2105  urease and hydrogenase maturation regulator/Ni2+-binding GTPase  45.13 
 
 
228 aa  214  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2370  cobalamin synthesis protein, P47K  45.73 
 
 
234 aa  214  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02420  nickel incorporation protein  44.89 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2610  cobalamin synthesis protein P47K  42.22 
 
 
234 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000165447  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2260  cobalamin synthesis protein P47K  41.59 
 
 
259 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0445  cobalamin synthesis protein P47K  44.25 
 
 
228 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1067  cobalamin synthesis protein/P47K  42.98 
 
 
233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0500  hypothetical protein  42.11 
 
 
236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0108  cobalamin synthesis protein, P47K  40.35 
 
 
235 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.83483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2980  cobalamin synthesis protein, P47K  41.23 
 
 
234 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2114  cobalamin synthesis protein, P47K  40.97 
 
 
235 aa  182  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2737  cobalamin synthesis protein P47K  43.17 
 
 
235 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.750152  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1793  cobalamin synthesis protein P47K  37.89 
 
 
235 aa  165  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4413  urease accessory protein UreG  30.53 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0499  hydrogenase accessory protein HypB  25.58 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0471  hydrogenase accessory protein HypB  24.56 
 
 
281 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0748  urease accessory protein UreG  30.16 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2717  urease accessory protein  29.33 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1082  urease accessory protein UreG  31.79 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3559  urease accessory protein  31.79 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29571  normal  0.0153059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1136  urease accessory protein UreG  31.79 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  28.96 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  29.63 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  29.1 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  29.1 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1464  urease accessory protein UreG  28.04 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2063  urease accessory protein UreG  25.64 
 
 
211 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000301925  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5119  urease accessory protein UreG  31.13 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0924  hydrogenase accessory protein HypB  25.41 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1302  urease accessory protein UreG  28.04 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2877  urease accessory protein UreG  28.42 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29751  urease accessory protein UreG  30.05 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1190  urease accessory protein UreG  31.76 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.257386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0513  hydrogenase accessory protein HypB  27.65 
 
 
271 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0723  urease accessory protein UreG  29.7 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1764  urease accessory protein UreG  30.11 
 
 
203 aa  52  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.861416  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0972  hydrogenase accessory protein HypB  28.57 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.423618  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  23.84 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3807  hydrogenase accessory protein HypB  26.97 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0504  hydrogenase accessory protein HypB  25.15 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  25.86 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1263  urease accessory protein  30.87 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1477  urease accessory protein UreG  31.76 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0957656  normal  0.435433 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4160  urease accessory protein UreG  30.41 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08891  urease accessory protein UreG  30.11 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1317  urease accessory protein UreG  30.46 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  27.17 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4032  urease accessory protein UreG  32 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.199977 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  26.74 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  25.86 
 
 
217 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2409  urease accessory protein UreG  27.37 
 
 
220 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2744  hydrogenase accessory protein HypB  26.55 
 
 
293 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2484  hydrogenase accessory protein HypB  28.73 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00892  urease accessory protein UreG  31.33 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.870329  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2997  urease accessory protein UreG  28.95 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.787106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4832  urease accessory protein UreG  30 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2360  urease accessory protein  31.08 
 
 
202 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0585  urease accessory protein UreG  31.65 
 
 
214 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.084211 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1851  hydrogenase expression/formation protein  27.95 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.163811  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4636  urease accessory protein UreG  32.43 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000195315  normal  0.0674257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2196  urease accessory protein UreG  29.05 
 
 
220 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358866  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2621  urease accessory protein UreG  29.8 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131688  normal  0.804945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2117  urease accessory protein UreG  30 
 
 
204 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3533  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 
229 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.490615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1347  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 
218 aa  48.9  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2753  urease accessory protein UreG  29.14 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0806758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  26.76 
 
 
283 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2451  urease accessory protein UreG  32.43 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.296243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1080  hydrogenase accessory protein HypB  24.14 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130841  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  24.31 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09380  urease accessory protein UreG  27.69 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3942  urease accessory protein UreG  29.47 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.452121  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0971  urease accessory protein UreG  30.41 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4248  urease accessory protein UreG  29.05 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  26.71 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1701  urease accessory protein UreG  28.21 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266659 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  25.29 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2187  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2840  urease accessory protein UreG  30.49 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0418  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 
215 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2060  urease accessory protein UreG  29.73 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>