36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0634 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 
120 aa  237  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  85 
 
 
120 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  85 
 
 
120 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  85 
 
 
120 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  61.67 
 
 
120 aa  157  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  57.14 
 
 
126 aa  141  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  53.45 
 
 
139 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  51.69 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  52.63 
 
 
117 aa  127  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  52.21 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  53.1 
 
 
121 aa  124  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  50.41 
 
 
122 aa  122  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 
117 aa  120  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  46.9 
 
 
117 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  44.25 
 
 
117 aa  110  7.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  45.08 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  46.02 
 
 
116 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  46.02 
 
 
117 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  46.02 
 
 
115 aa  105  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  41.38 
 
 
122 aa  98.2  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  43.86 
 
 
119 aa  97.1  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  38.79 
 
 
122 aa  96.7  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  41.59 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  43.1 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  44.04 
 
 
117 aa  94  6e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  35.96 
 
 
115 aa  84.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  38.02 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  24.39 
 
 
192 aa  47.8  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  27.62 
 
 
184 aa  45.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  34.04 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1112  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19861  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.129304  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  24.41 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  34.09 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>