More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3010 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  100 
 
 
137 aa  278  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  86.13 
 
 
137 aa  245  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  84.67 
 
 
142 aa  242  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  84.85 
 
 
135 aa  239  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  80.3 
 
 
135 aa  228  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  77.94 
 
 
138 aa  228  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  76.47 
 
 
138 aa  224  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  76.47 
 
 
138 aa  224  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  76.3 
 
 
136 aa  213  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  78.46 
 
 
132 aa  213  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  78.46 
 
 
132 aa  213  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  78.91 
 
 
128 aa  211  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  76.92 
 
 
132 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  76.92 
 
 
138 aa  207  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  76.92 
 
 
144 aa  205  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  76.92 
 
 
132 aa  205  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  74.62 
 
 
133 aa  204  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  75.78 
 
 
129 aa  203  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  73.85 
 
 
132 aa  201  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  80 
 
 
138 aa  200  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  74.62 
 
 
150 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  71.43 
 
 
151 aa  197  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  70.77 
 
 
133 aa  195  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  79.49 
 
 
138 aa  193  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  79.49 
 
 
138 aa  193  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  69.7 
 
 
347 aa  192  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  72.73 
 
 
136 aa  191  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  71.54 
 
 
133 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  76.92 
 
 
138 aa  190  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  70.77 
 
 
133 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  68.18 
 
 
134 aa  189  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  71.54 
 
 
137 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  76.92 
 
 
138 aa  186  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  74.17 
 
 
135 aa  185  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  73.5 
 
 
146 aa  180  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  65.38 
 
 
334 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  65 
 
 
137 aa  169  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  59.85 
 
 
138 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  60.15 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  61.72 
 
 
142 aa  149  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 
153 aa  123  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.87 
 
 
318 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  50 
 
 
313 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  48.33 
 
 
315 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  48.33 
 
 
315 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  43.65 
 
 
129 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  45 
 
 
316 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  44.17 
 
 
314 aa  103  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  46.67 
 
 
314 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
139 aa  103  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  46.67 
 
 
314 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  46.67 
 
 
312 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 
138 aa  102  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  46.67 
 
 
314 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  45.13 
 
 
306 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  43.7 
 
 
142 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  45.83 
 
 
314 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  44.44 
 
 
317 aa  101  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  45 
 
 
313 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  44.44 
 
 
310 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
138 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  45.83 
 
 
314 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  43.33 
 
 
316 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.77 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
131 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.46 
 
 
321 aa  98.6  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  45.6 
 
 
317 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  41.96 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  46.61 
 
 
302 aa  98.6  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  46.34 
 
 
320 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 
147 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  46.34 
 
 
320 aa  96.7  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  39.2 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  43.08 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  39.57 
 
 
400 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.31 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
129 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  39.52 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  39.2 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.41 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.41 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  39.2 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  39.52 
 
 
132 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 
129 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 
129 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.41 
 
 
138 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.21 
 
 
131 aa  93.6  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  38.84 
 
 
329 aa  92.8  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  40 
 
 
130 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>