More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1856 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 337 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.61 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.5 
 
 		 340 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5375  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.52 
 
 		 342 aa  278  8e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.296899  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.32 
 
 		 333 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  38.28 
 
 		 339 aa  262  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 		 329 aa  252  7e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.948745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 336 aa  248  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4050  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.46 
 
 		 337 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0717  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 		 338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 		 333 aa  232  6e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000322853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 		 337 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298379  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 		 338 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0727691 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.678107  normal  0.316578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 		 364 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1583  alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.354079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0928  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.42 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 		 332 aa  219  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 		 335 aa  218  7.999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18030  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  37.35 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.111375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.721542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2947  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.09 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.728806  normal  0.808903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  35.03 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 		 351 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1530  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.755182  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1585  dipeptide ABC transporter, permease protein  37.2 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.61 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1081  peptide ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.446829  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.905382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 		 335 aa  212  9e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.87 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268081  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  34.63 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2419  ABC transporter D-Ala-D-Ala-binding inner membrane protein  35.26 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.279427  hitchhiker  0.0000166625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2705  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 		 345 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  34.33 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  34.33 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0330  nickel-transporting ATPase  36.53 
 
 		 334 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  34.33 
 
 		 306 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 		 306 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 		 334 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0103751  normal  0.0395583 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 		 334 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 		 352 aa  209  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1098  peptide ABC transporter, permease protein  36.94 
 
 		 336 aa  208  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0391  Nickel-transporting ATPase  36.23 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.941274  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.237541  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01444  D-ala-D-ala transporter subunit  38.72 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.982069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0198405  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01456  hypothetical protein  38.72 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2098  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  38.72 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.01 
 
 		 334 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 		 336 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1675  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  38.72 
 
 		 340 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.925292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1687  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  38.72 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.930254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3004  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  34.63 
 
 		 336 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1571  inner membrane ABC transporter permease protein yddR  38.72 
 
 		 340 aa  205  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.73 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  35.93 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.73 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.73 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.73 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  33.73 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.73 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  33.93 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4074  dipeptide transporter permease DppB  33.43 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0089  dipeptide transporter permease DppB  33.43 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  33.73 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 		 383 aa  202  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  33.43 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  34.33 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 		 355 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.800769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  34.33 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1691  alkaline phosphatase  36.61 
 
 		 336 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 		 306 aa  202  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.913097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  33.73 
 
 		 339 aa  202  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.63 
 
 		 355 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.699223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.740963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>