More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0883 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0883  methyltransferase type 11  100 
 
 
191 aa  375  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00365145  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0256  methlytransferase  47.09 
 
 
200 aa  180  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272291  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1487  methyltransferase type 11  45.24 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  47.31 
 
 
219 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  46.71 
 
 
213 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  43.11 
 
 
207 aa  156  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  45.24 
 
 
208 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0840  methyltransferase type 11  36.63 
 
 
210 aa  147  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000045318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  38.73 
 
 
209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.17 
 
 
503 aa  143  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3275  Methyltransferase type 11  40.72 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00288656  normal  0.645972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2127  methyltransferase type 11  41.71 
 
 
229 aa  134  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0382045  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1551  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.669083  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  37.14 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0544  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
212 aa  114  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0016502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1193  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
215 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0170367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1780  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
212 aa  106  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115692  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0954  Methyltransferase type 11  35.67 
 
 
204 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.118229  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12035  hypothetical protein  38.92 
 
 
285 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0871  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1860  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.762875 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1393  methyltransferase type 11  33.52 
 
 
203 aa  87.8  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0409  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
210 aa  84.3  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1031  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0910  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.105368  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0864  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
235 aa  74.7  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.81939  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1314  methyltransferase type 11  34.3 
 
 
224 aa  71.2  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.490863 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.64 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
265 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  43.96 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6852  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 
217 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18943  normal  0.739847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
239 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
327 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  28.57 
 
 
307 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
248 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
262 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  40.22 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
248 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
205 aa  58.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
243 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  23.41 
 
 
213 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  30.85 
 
 
258 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
216 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
252 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  35.85 
 
 
210 aa  54.7  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0692  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.27 
 
 
345 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 
261 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
264 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
251 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1986  methyltransferase type 11  30.58 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.110241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
261 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  26.09 
 
 
305 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.5 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.85 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
317 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
239 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
305 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  30.18 
 
 
328 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.12 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
232 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1459  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
190 aa  52  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.244639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
257 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0691  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
206 aa  51.2  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  29.2 
 
 
658 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  29.57 
 
 
342 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
273 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  28.49 
 
 
225 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  26.4 
 
 
215 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  32.41 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  30.86 
 
 
324 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  24.39 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.06 
 
 
283 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
309 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  29.03 
 
 
310 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
275 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  37.11 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  36.08 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  22.05 
 
 
211 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
178 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1282  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>