40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2193 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  100 
 
 		 245 aa  490  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  66.12 
 
 		 245 aa  347  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  51.02 
 
 		 244 aa  262  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  51.01 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  49.8 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  46.96 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  46.56 
 
 		 261 aa  240  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  44.13 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  45.75 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1463  DNA polymerase sliding clamp  44.13 
 
 		 247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1253  DNA polymerase sliding clamp  43.72 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  44.53 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  44.13 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1488  DNA polymerase sliding clamp  38.46 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  38.56 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  34.26 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  31.23 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.92 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  29.92 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.13 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.08 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.08 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.57 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.98 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  28.85 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.42 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  28.69 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.12 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  28.34 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  22.81 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.98 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  23.43 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  25.61 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  23.16 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  24.81 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  20.99 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00880  DNA polymerase processivity factor, putative  40 
 
 		 343 aa  48.9  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  21.31 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  21.63 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  21.05 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>