260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1426 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 432 aa  898    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.05 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 432 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 540 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  50.84 
 
 		 418 aa  429  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  48.94 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  50.36 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 534 aa  292  9e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 542 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  56.65 
 
 		 570 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 537 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 358 aa  232  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 361 aa  228  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 358 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 358 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 381 aa  107  6e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.68 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 377 aa  97.4  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  22.38 
 
 		 424 aa  97.1  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 		 407 aa  96.7  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 379 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  27.91 
 
 		 484 aa  89.7  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  24.31 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.15 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.51 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  23.86 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.06 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.34 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.37 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.77 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.98 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.72 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.38 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.21 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1867  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705084  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  25.3 
 
 		 641 aa  63.2  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0935  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.25 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.96 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14880  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.97 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00197202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0579  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6470  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0670  tryptophanyl-tRNA synthetase  31.61 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167937 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.59 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.13 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.01 
 
 		 328 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.33 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 		 330 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  28 
 
 		 325 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3900  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.93635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1044  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.46 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 333 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  23.34 
 
 		 330 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1340  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.05 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.91 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.25 
 
 		 324 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0915  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.4 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.229161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.25 
 
 		 327 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4636  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.0639753 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1317  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.53 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0172213  normal  0.0239999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.49 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0021  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1263  Tryptophan--tRNA ligase  29.65 
 
 		 334 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0012  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 344 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00178071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>