81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1412 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1412  hydrogenase expression/synthesis, HypA  100 
 
 		 114 aa  234  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0480002  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1023  hydrogenase expression/synthesis, HypA  66.07 
 
 		 113 aa  160  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0934  hydrogenase expression/synthesis, HypA  61.26 
 
 		 111 aa  154  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00722014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1736  hydrogenase expression/synthesis HypA  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.115348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0365  hypothetical protein  58.41 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1850  hydrogenase nickel incorporation protein  29.55 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0816478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19820  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  32.76 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.46 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.644029 
 
 
-
 
NC_002936  DET1430  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.48 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.799763  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11730  Zn finger protein HypA/HybF (possibly regulating hydrogenase expression)  27.12 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1212  hydrogenase nickel insertion protein HypA  32.48 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0774927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1669  hydrogenase expression/formation protein HypA  28.23 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1238  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.62 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1312  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.4 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.183379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2011  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.78 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2489  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.37 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2830  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.91 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1898  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.5 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030561 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0929  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.19 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11958  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2039  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.86 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3749  hydrogenase expression/synthesis HypA  30.09 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0476  hydrogenase formation/expression  29.2 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.653213  normal  0.217154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0024  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.37 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2334  hydrogenase expression/synthesis HypA  30 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3287  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2885  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.07 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.305535  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1094  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.3 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1811  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2089  hydrogenase expression/formation protein HypA  32.5 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1787  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.77 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000697266  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1766  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.58 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.506604  normal  0.950771 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1498  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.03 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.130745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1832  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.1 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.524005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2181  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.82 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2415  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.81 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0774419  hitchhiker  0.0000872958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1879  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.27 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1424  hydrogenase expression/synthesis, HypA  30.17 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2053  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.25 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1535  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.82 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000589093  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1904  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.97 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0320929  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0426  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.21 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1199  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.78169  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0047  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.57 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.729496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1867  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.77 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0437  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.21 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.525876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3220  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.5 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0449  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.57 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3880  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.19 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.451178  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1459  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.09 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3366  hypothetical protein  26.72 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.256486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3979  hydrogenase expression/synthesis, HypA  27.87 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1812  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.68 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2165  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.68 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0650  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.235635  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2132  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.7 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.509828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1303  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.263812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0720  hydrogenase expression/synthesis, HypA  31.9 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.973117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4095  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.23 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3365  hydrogenase nickel insertion protein HypA  30.25 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1088  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.27 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.909847  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1911  hydrogenase nickel insertion protein HypA  27.12 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0043415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3166  hydrogenase expression/synthesis HypA  31.9 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0373089 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1373  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.673816  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1308  hydrogenase nickel insertion protein HypA, putative  32.2 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000254152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0717  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.95 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3188  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.8 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.584695 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1517  hydrogenase nickel insertion protein HypA  29.91 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0160728  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0865  hydrogenase expression/synthesis HypA  28.95 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.71265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2782  hydrogenase nickel insertion protein HypA  28.32 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0757  hydrogenase expression/synthesis HypA  27.73 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.497459  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3107  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.09 
 
 		 113 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0787  hydrogenase expression/formation protein HypA  29.79 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.482167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4607  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.32 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1889  hydrogenase nickel insertion protein HypA  26.67 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3921  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.44 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.213712  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1042  hydrogenase nickel insertion protein HypA  31.75 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1755  hydrogenase expression/synthesis, HypA  28 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0656  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.56 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1649  hydrogenase expression/synthesis, HypA  26.13 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1159  hydrogenase nickel insertion protein HypA  24.17 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.938764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2019  hydrogenase nickel insertion protein HypA  25.44 
 
 		 113 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>