More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1151 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1151  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 
231 aa  455  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  40.85 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174302  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2083  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  37.5 
 
 
223 aa  116  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0961871  normal  0.884779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2036  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.84 
 
 
226 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4773  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  36 
 
 
231 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.366276 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1532  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.58 
 
 
228 aa  108  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000919754  unclonable  2.03359e-19 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0186  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.51 
 
 
210 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.969233  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0319  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.02 
 
 
211 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0238  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.03 
 
 
210 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  34.93 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0187  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.66 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1818  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.06 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.397202 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  31.86 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.86 
 
 
218 aa  93.6  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0253  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.592133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0372  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.68 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3804  putative transmembrane protein  28.9 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0258  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0133581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.73 
 
 
210 aa  89  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1348  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  34.62 
 
 
208 aa  88.6  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.160191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1365  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.25 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0953  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 
207 aa  87.8  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.838216  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1125  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.23 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0974003 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  28.97 
 
 
214 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  28.97 
 
 
214 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3813  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.14 
 
 
206 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0677256  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001122  multiple antibiotic resistance protein marC  30.05 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00063359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  28.5 
 
 
214 aa  85.5  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  30.09 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0331  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.34 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2508  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.07 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120905  normal  0.115673 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.77 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4785  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  28.86 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  28.78 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  28.86 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  28.86 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  28.86 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  28.86 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.99 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  30.58 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2943  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.86 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.434605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3108  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  26.73 
 
 
207 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5252  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.68 
 
 
213 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.732321 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1540  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  31.19 
 
 
206 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29956  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2896  multidrug ABC transporter  31.19 
 
 
206 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06663  hypothetical protein  30.05 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2143  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  34.16 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2978  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.17 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000715801  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  29.8 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7011  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.66 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0559701  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2679  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.36 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2731  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.63 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0312653  normal  0.203712 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0428  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  25.36 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1390  hypothetical protein  30.3 
 
 
215 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.718233  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5328  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  35.32 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1844  hypothetical protein  28.5 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.678437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3526  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.88 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303666  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.21 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0784  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.76 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  29.35 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1791  MarC membrane protein  26.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2711  MarC membrane protein  26.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3721  MarC membrane protein  26.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3690  hypothetical protein  26.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.984937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2762  MarC membrane protein  26.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3663  MarC membrane protein  26.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2990  hypothetical protein  26.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.792349  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1394  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3557  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.84 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247513  hitchhiker  0.0000492857 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6435  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  33.17 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2436  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3242  MarC membrane protein  26.57 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6025  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0264079 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0407  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.36 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  31.58 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2756  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.71 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.39 
 
 
211 aa  79  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2879  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.22 
 
 
207 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0513768 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.88 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3245  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.64 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0355  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  25.36 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.458882 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.88 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2507  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.28 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.357555  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0401  MarC family multiple antibiotic resistance protein  30.84 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 
193 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0346  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.88 
 
 
206 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  32.18 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.4 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0417  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.43 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>