More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2056 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2056  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  100 
 
 		 193 aa  368  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0524  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  61.9 
 
 		 192 aa  241  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0996  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  54.84 
 
 		 189 aa  219  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.643344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5115  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  52.69 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2433  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  53.01 
 
 		 191 aa  205  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.382546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1119  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  47.85 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02065  putative transmembrane protein  60.21 
 
 		 193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808084  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1097  hypothetical protein  46.41 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.177392 
 
 
-
 
NC_002950  PG0224  hypothetical protein  44.86 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0570  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  33.17 
 
 		 217 aa  100  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1498  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  39.07 
 
 		 219 aa  97.1  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1449  MarC membrane protein  29.38 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000727679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1098  hypothetical protein  31.37 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1059  hypothetical protein  30.54 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.728304  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1240  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.86 
 
 		 209 aa  87.8  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185324  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2164  hypothetical protein  29.23 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.033055  normal  0.026113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2071  hypothetical protein  28.72 
 
 		 214 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0381177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1962  hypothetical protein  28.72 
 
 		 214 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3842  putative dITP- and XTP- hydrolase  30.46 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.784378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0054  integral membrane protein, MarC family  29.19 
 
 		 216 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.207585  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2196  hypothetical protein  28.06 
 
 		 214 aa  85.1  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08146  multiple antibiotic resistance protein MarC  32.84 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2143  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2648  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.18 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0106  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.05 
 
 		 200 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4140  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.5 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2597  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.93 
 
 		 203 aa  84.3  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370688  normal  0.182798 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0055  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.13 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0468967  normal  0.907646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0558  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.05 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  hitchhiker  0.000600217 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1278  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.42 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0588  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30.05 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2703  hypothetical protein  28.21 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000872945  hitchhiker  0.000692167 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2795  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.57 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2843  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0516  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.57 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0622801  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3941  putative dITP- and XTP- hydrolase  27.98 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0491  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  30 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.51349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2183  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.37 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.118995  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2645  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.32 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3058  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.429511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3913  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.43 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3226  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.53 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03286  predicted antibiotic transporter  28.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.541107  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0280  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3519  MarC membrane protein  29.02 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2516  MarC membrane protein  29.02 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.376397  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3442  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00112955  hitchhiker  0.00103877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3517  hypothetical protein  29.02 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.836337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1297  MarC membrane protein  29.02 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0438  MarC membrane protein  29.02 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4746  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.886657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3890  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0278  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3716  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3634  putative dITP- and XTP- hydrolase  28.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3481  MarC membrane protein  29.02 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.371296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03239  hypothetical protein  28.43 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.705152  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3266  MarC membrane protein  29.02 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1556  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.38 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0847  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.73 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0772  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.94 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0654  multiple drug resistance protein MarC  29.33 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1815  MarC family integral membrane protein  32.43 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.862942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1323  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.15 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2813  hypothetical protein  31.94 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.864599  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0381  MarC membrane protein  32.43 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0139422  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2097  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.5 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03019  hypothetical protein  28.93 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2949  hypothetical protein  28.87 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0561  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  31.28 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.143657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1397  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126468  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1938  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.476555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3673  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  28.5 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.543765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1147  hypothetical protein  29.53 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.938365  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1406  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.17 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1270  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.58 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1881  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.66407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1875  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.67019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1228  membrane transporter, MarC family  29.94 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1580  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.439502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1410  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  32.97 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2045  hypothetical protein  27.18 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00255531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0514  multiple antibiotic resistance (MarC)- related protein, putative transporter  31.28 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.708119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1251  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.38 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000866197  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2303  hypothetical protein  24.88 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.45168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0686  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  27.7 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0188  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.65 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1880  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  30.16 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4013  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.13 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.648921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002930  multiple antibiotic transporter  27.69 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000449619  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1407  hypothetical protein  27.69 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.090251  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1233  hypothetical protein  31.77 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01216  predicted inner membrane protein  28.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2408  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  28.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022238  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1900  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  0.103806 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0614  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  29.19 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2386  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.377039  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1726  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.345038  normal  0.523448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1351  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000939425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01226  hypothetical protein  28.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>