274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1050 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1050  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  100 
 
 		 392 aa  813    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0931794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1614  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  69.05 
 
 		 392 aa  591  1e-168  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.193363  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0071  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  66.84 
 
 		 393 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0929376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0348  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 392 aa  561  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0463622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2180  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  62.4 
 
 		 456 aa  531  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1214  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  62.4 
 
 		 392 aa  526  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000547302  normal  0.0195225 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2045  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 454 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1209  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  63.38 
 
 		 459 aa  521  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1163  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  61.89 
 
 		 462 aa  518  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.937878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0796  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 459 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0554  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 381 aa  265  7e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1638  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0681  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 385 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1440  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 387 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0486  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1433  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.498854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0351  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0102  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  26.5 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.69 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  26.56 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  26.11 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  39.47 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.3 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  38.03 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  28 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.11 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.64 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.25 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  28.17 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3228  kynureninase  34.25 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  27.59 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.03 
 
 		 413 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.94 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.21 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.03 
 
 		 413 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  26.24 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.52 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  26.57 
 
 		 416 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.94 
 
 		 429 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25440  cysteine desulfurase family protein  26.62 
 
 		 380 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0587445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0787  kynureninase  38.33 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.94 
 
 		 429 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0734  kynureninase  32.88 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.94 
 
 		 429 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001209  aminotransferase ScrA  34.52 
 
 		 469 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  25 
 
 		 413 aa  53.5  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1300  cysteine desulphurase-like protein  26.24 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0145428  hitchhiker  0.00325394 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  24.28 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  26.24 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3511  kynureninase  25.27 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.76 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.42 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  24.37 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0775  kynureninase  29.03 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379784  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0709  kynureninase  29.03 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.540456  normal  0.132012 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.35 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.53 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.16 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.5 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2279  cysteine desulfurase  21.45 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0879534  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.16 
 
 		 406 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.96 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.17 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0265  kynureninase  30.77 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  26.24 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  21.58 
 
 		 572 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.91 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  28.06 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  23.05 
 
 		 382 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.19 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  26.97 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.71 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  25.49 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.73 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.74 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  25.68 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  24.43 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  23.56 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  24.01 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  33.8 
 
 		 476 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.04 
 
 		 608 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.3 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  26.06 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0759  hydrolase protein  25.81 
 
 		 417 aa  50.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.232053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.56 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.73 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1868  aminotransferase, class V  25.44 
 
 		 380 aa  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.93 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2214  cysteine desulphurase-like protein  26.28 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0350826  hitchhiker  0.000530193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.87 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0507  kynureninase  32.93 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0151824 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.46 
 
 		 412 aa  49.7  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2118  kynureninase  24.23 
 
 		 409 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.95 
 
 		 678 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.49 
 
 		 451 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.25 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.96 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>