32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0553 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 		 154 aa  315  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  76.62 
 
 		 153 aa  246  8e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  75.97 
 
 		 153 aa  244  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  74.03 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  72.73 
 
 		 153 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  58.44 
 
 		 153 aa  187  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  57.14 
 
 		 153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  52.29 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  51.3 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  47.4 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  46.79 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  46.79 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  45.18 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  50 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  42.51 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  41.92 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  41.29 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  42.31 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  45.71 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  43.98 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  42.95 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  39.74 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  36.31 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  34.44 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  31.61 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  32.61 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22774  predicted protein  24.24 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30488  Ribosomal protein L7, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  22.5 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3399  ribosomal protein L30  37.5 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.34793  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66370  60S large subunit ribosomal protein  25.6 
 
 		 241 aa  43.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78437  normal  0.0538769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>