28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1849 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  71.61 
 
 		 155 aa  235  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  69.68 
 
 		 155 aa  228  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  69.48 
 
 		 154 aa  226  7e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  69.48 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  45.16 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  42.86 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  45.81 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  43.23 
 
 		 153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  40.65 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  41.29 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  39.87 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  40.65 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  38.31 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  42.31 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  36.69 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  36.69 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  36.69 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  37.14 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  26.62 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  28.76 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  28.92 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  29.68 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  27.54 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  28.4 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  27.71 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  25.15 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  28.37 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>