38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0463 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 		 153 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  75.97 
 
 		 154 aa  244  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  71.9 
 
 		 153 aa  234  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  71.9 
 
 		 153 aa  230  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  67.97 
 
 		 153 aa  220  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  60.13 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  54.9 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  53.29 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  49.67 
 
 		 151 aa  153  8e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  54.68 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  54.68 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  54.68 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  47.71 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  46.79 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  45.51 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  41.29 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  52.52 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  42.42 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  40.91 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  41.94 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  39.35 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  39.16 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  37.95 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  40 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  36.18 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  34 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  36.09 
 
 		 185 aa  96.3  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  35.77 
 
 		 155 aa  67  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22774  predicted protein  25.16 
 
 		 239 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30488  Ribosomal protein L7, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  25 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66370  60S large subunit ribosomal protein  26.11 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78437  normal  0.0538769 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  40 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 61 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 62 aa  40.8  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  40.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>