28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0231 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  100 
 
 
155 aa  317  5e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  85.81 
 
 
155 aa  278  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  71.61 
 
 
154 aa  235  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  64.52 
 
 
154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  63.87 
 
 
154 aa  201  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  48.72 
 
 
153 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  46.79 
 
 
153 aa  138  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  47.44 
 
 
153 aa  137  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  48.08 
 
 
153 aa  136  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  46.15 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  46.79 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  44.52 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  41.67 
 
 
153 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  41.67 
 
 
154 aa  117  6e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  37.42 
 
 
158 aa  105  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  41.13 
 
 
154 aa  105  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  39.01 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  39.01 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  39.01 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  29.03 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  31.1 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  32.26 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  29.87 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  30.36 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  27.98 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  29.94 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  29.41 
 
 
185 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  26.14 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>