30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0731 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 
154 aa  306  5e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  88.31 
 
 
154 aa  257  4e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  88.31 
 
 
154 aa  257  4e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  88.31 
 
 
154 aa  257  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  67.53 
 
 
154 aa  228  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  54.9 
 
 
153 aa  166  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  50.98 
 
 
153 aa  163  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  52.29 
 
 
158 aa  159  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  52.29 
 
 
153 aa  157  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  53.59 
 
 
153 aa  157  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  50.98 
 
 
153 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  51.97 
 
 
151 aa  152  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  49.67 
 
 
153 aa  147  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  49.35 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  46.75 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  42.86 
 
 
156 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  45.45 
 
 
155 aa  120  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  41.32 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  41.07 
 
 
179 aa  115  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  37.25 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  38.69 
 
 
175 aa  106  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  40.52 
 
 
154 aa  104  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  41.32 
 
 
176 aa  100  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  38.1 
 
 
185 aa  99  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  35.76 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  35.06 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  35.95 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  37.14 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22774  predicted protein  28.12 
 
 
239 aa  63.9  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30488  Ribosomal protein L7, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  26.83 
 
 
239 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.655179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>