21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_66370 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_66370  60S large subunit ribosomal protein  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78437  normal  0.0538769 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07107  60S ribosomal protein L7 (AFU_orthologue; AFUA_4G03880)  62.87 
 
 		 251 aa  289  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.135694  normal  0.632597 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30488  Ribosomal protein L7, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  52.28 
 
 		 239 aa  261  4.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06360  60s ribosomal protein l7, putative  56.41 
 
 		 250 aa  255  6e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22774  predicted protein  47.66 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14450  predicted protein  40.62 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62698  predicted protein  36.93 
 
 		 287 aa  108  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.0000253045  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  29.7 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  30.38 
 
 		 151 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  27.95 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  28.14 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  28.22 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  26.04 
 
 		 177 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  26.38 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  26.11 
 
 		 153 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  25.47 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  27.67 
 
 		 154 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  27.04 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  25.6 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  24.84 
 
 		 153 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  25.88 
 
 		 175 aa  42.4  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>