30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0102 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 		 153 aa  314  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  76.62 
 
 		 154 aa  246  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  71.9 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  71.9 
 
 		 153 aa  234  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  69.28 
 
 		 153 aa  230  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  60.13 
 
 		 153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  54.25 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  51.32 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  52.94 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  50.33 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  52.52 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  52.52 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  52.52 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  44.85 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  49.64 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  45.51 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  46.15 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  42.77 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  41.57 
 
 		 179 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  41.56 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  40.65 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  44.24 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  41.94 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  40 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  36.53 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  34.42 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  31.17 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  32.85 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30488  Ribosomal protein L7, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  23.08 
 
 		 239 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.655179 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66370  60S large subunit ribosomal protein  24.84 
 
 		 241 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78437  normal  0.0538769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>