28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2239 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2239  ribosomal protein L30P  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0231  ribosomal protein L30P  85.81 
 
 		 155 aa  278  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1849  ribosomal protein L30P  69.68 
 
 		 154 aa  228  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685217 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2428  50S ribosomal protein L30P  65.16 
 
 		 154 aa  210  7e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2313  50S ribosomal protein L30P  63.23 
 
 		 154 aa  196  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0089  50S ribosomal protein L30P  49.36 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0139632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1707  50S ribosomal protein L30P  45.16 
 
 		 151 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.144024  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0463  50S ribosomal protein L30P  45.51 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0102  50S ribosomal protein L30P  45.51 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.805904 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0553  50S ribosomal protein L30P  46.79 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.929713  normal  0.433723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2232  50S ribosomal protein L30P  44.87 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17243  normal  0.618082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0585  50S ribosomal protein L30P  47.44 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0022  50S ribosomal protein L30P  42.95 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000081539  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0731  50S ribosomal protein L30P  43.26 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125981  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1405  50S ribosomal protein L30P  39.61 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1500  ribosomal protein L30P  37.42 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0665  50S ribosomal protein L30P  40.43 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00686954 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1253  50S ribosomal protein L30P  40.43 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0343817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0158  50S ribosomal protein L30P  40.43 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0191221  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1307  50S ribosomal protein L30P  32.32 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.313332  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1757  ribosomal protein L30P  26.45 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.113984  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0235  50S ribosomal protein L30P  30.52 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0778  50S ribosomal protein L30P  30.59 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1207  50S ribosomal protein L30P  30 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0314  50S ribosomal protein L30P  31.95 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0112  50S ribosomal protein L30P  29.87 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000210294  unclonable  0.000000357235 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1057  50S ribosomal protein L30P  30.59 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.022347  hitchhiker  0.0000000491432 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0400  50S ribosomal protein L30P  26.95 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0676264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>