40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2917 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1069    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1230 aa  90.5  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1001  hypothetical protein  31.54 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234002  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  36.89 
 
 		 1316 aa  63.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  45.78 
 
 		 3907 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  47.14 
 
 		 692 aa  60.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  34.75 
 
 		 14609 aa  60.1  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  46.3 
 
 		 830 aa  60.1  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  37.35 
 
 		 866 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  33.61 
 
 		 4009 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.5 
 
 		 1831 aa  56.2  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2833  hypothetical protein  46.55 
 
 		 310 aa  54.3  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0557119  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  46.38 
 
 		 3027 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  40.4 
 
 		 1487 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  32.77 
 
 		 4022 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  32 
 
 		 3822 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  37.78 
 
 		 1908 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0415  hypothetical protein  47.06 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  24.6 
 
 		 1980 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  33.13 
 
 		 1394 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  40.24 
 
 		 767 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  33.33 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2938  transglutaminase domain-containing protein  32.52 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1348  hypothetical protein  43.64 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1168  hypothetical protein  28.04 
 
 		 194 aa  47.4  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1107 aa  47  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  31.69 
 
 		 462 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1609  hypothetical protein  38.6 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.393788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0486  hypothetical protein  27.34 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  31.18 
 
 		 1986 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0477  hypothetical protein  35.94 
 
 		 363 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3205  hypothetical protein  25.91 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168746  normal  0.0109515 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  46.27 
 
 		 1188 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0551  transglutaminase domain protein  43.48 
 
 		 302 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  43.24 
 
 		 476 aa  44.3  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2907  hypothetical protein  28.14 
 
 		 301 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  34.41 
 
 		 3861 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2469  transglutaminase domain-containing protein  45.65 
 
 		 313 aa  43.5  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.451679 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  26.67 
 
 		 2125 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  26.67 
 
 		 2125 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>