24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0486 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0486  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  776    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1001  hypothetical protein  31.91 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  25.76 
 
 		 1991 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.1 
 
 		 1986 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  26.44 
 
 		 1950 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2089  hypothetical protein  21.46 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  31.88 
 
 		 1980 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  28.22 
 
 		 1958 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  24.71 
 
 		 2013 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  28.83 
 
 		 1983 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  22.58 
 
 		 1958 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  25.93 
 
 		 1973 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1939  DNA helicase-related protein  21.69 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  23.47 
 
 		 1945 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  21.34 
 
 		 1754 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  21.61 
 
 		 1959 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  24.46 
 
 		 2207 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  23.35 
 
 		 2197 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  22.58 
 
 		 2016 aa  50.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  22.22 
 
 		 2198 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  27.34 
 
 		 527 aa  46.2  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  23.08 
 
 		 2005 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  22.75 
 
 		 2125 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  22.75 
 
 		 2125 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>