17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2089 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG2089  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  809    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0486  hypothetical protein  22.37 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1001  hypothetical protein  29.61 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234002  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  27.76 
 
 
2005 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  25.65 
 
 
2222 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  25.66 
 
 
2013 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  29.93 
 
 
1980 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  22.95 
 
 
1991 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  23.94 
 
 
2207 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  25.41 
 
 
2016 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1939  DNA helicase-related protein  24.65 
 
 
402 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  25.29 
 
 
1950 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  25.58 
 
 
1959 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  24.22 
 
 
1945 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  28.57 
 
 
2125 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  28.57 
 
 
2125 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  27.27 
 
 
527 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>