28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1001 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1001  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  971    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.234002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0486  hypothetical protein  31.91 
 
 		 380 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  31.68 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  34.11 
 
 		 1991 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_002950  PG2089  hypothetical protein  41.67 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  29.65 
 
 		 1986 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  32.86 
 
 		 1983 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  31.03 
 
 		 1958 aa  63.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  25.58 
 
 		 1754 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 1230 aa  61.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  24.37 
 
 		 1958 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  32.28 
 
 		 1973 aa  59.3  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  31.11 
 
 		 2005 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  31.5 
 
 		 2013 aa  56.6  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  26.29 
 
 		 1959 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  27.13 
 
 		 1950 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  26.27 
 
 		 2125 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  26.27 
 
 		 2125 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1939  DNA helicase-related protein  27.48 
 
 		 402 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  25 
 
 		 2207 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  29.41 
 
 		 1980 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  22.79 
 
 		 2222 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  27.56 
 
 		 2197 aa  51.2  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  29.92 
 
 		 1945 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  23.33 
 
 		 2204 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  26.77 
 
 		 2016 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3205  hypothetical protein  23.81 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168746  normal  0.0109515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  26.77 
 
 		 2198 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>