124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1903 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  87.38 
 
 		 545 aa  741    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  100 
 
 		 417 aa  850    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  49.4 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  49.4 
 
 		 536 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  48.56 
 
 		 534 aa  391  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  49.16 
 
 		 536 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  49.16 
 
 		 536 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  48.33 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  48.33 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  47.34 
 
 		 531 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  47.34 
 
 		 531 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  46.23 
 
 		 539 aa  349  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  46.23 
 
 		 539 aa  349  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  46.23 
 
 		 539 aa  349  6e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  46.83 
 
 		 507 aa  330  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  39.61 
 
 		 534 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  34.91 
 
 		 544 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  34.91 
 
 		 544 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  33.57 
 
 		 537 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2827  hypothetical protein  41.46 
 
 		 374 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.46901  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  50.98 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0232  transposase (IS4 family protein)  30.77 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0838  transposase (IS4 family protein)  30.77 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1862  transposase (IS4 family protein)  30.77 
 
 		 560 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0324355  normal  0.381496 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1547  transposase family protein  30.77 
 
 		 560 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000707148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1432  transposase family protein  30.95 
 
 		 560 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2229  transposase family protein  30.95 
 
 		 560 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000971975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0181  transposase  26.7 
 
 		 552 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0335  transposase  26.7 
 
 		 552 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1400  transposase  26.7 
 
 		 552 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0248  transposase  27.55 
 
 		 552 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0976  transposase  27.55 
 
 		 552 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2953  transposase  27.55 
 
 		 552 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00221039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3055  transposase  27.55 
 
 		 552 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1808  transposase  26.7 
 
 		 552 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0574  transposase  27.55 
 
 		 552 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1514  transposase  27.27 
 
 		 552 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3103  transposase  27.27 
 
 		 552 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000596563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1351  transposase  26.45 
 
 		 552 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2717  transposase  26.63 
 
 		 552 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0521  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0714  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.799993  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1060  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.807902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1497  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00603607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1510  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.03574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2034  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2556  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0309  transposase  26.49 
 
 		 552 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1078  transposase  26.26 
 
 		 552 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1923  transposase  26.24 
 
 		 552 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2935  transposase  26.2 
 
 		 552 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1446  transposase  26.3 
 
 		 552 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1724  transposase  31.5 
 
 		 402 aa  103  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000337952  normal  0.570095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  62.34 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2828  hypothetical protein  52.87 
 
 		 101 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0550197  normal  0.193636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2599  Transposase-like protein  23.57 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0014621  hitchhiker  0.00315574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2655  Transposase-like protein  23.57 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000825178  hitchhiker  0.000880937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  23.88 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  24.35 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  21.94 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  21.94 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  21.94 
 
 		 548 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  21.6 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  21.6 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  21.6 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  21.6 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  21.6 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  20.95 
 
 		 604 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  22.58 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3413  Transposase-like protein  22.19 
 
 		 603 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.44774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3882  Transposase-like protein  22.37 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.693522  normal  0.254158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0467  Transposase-like protein  22.37 
 
 		 604 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.109901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0922  Transposase-like protein  22.37 
 
 		 604 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0253414  hitchhiker  0.0000493668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1841  Transposase-like protein  22.37 
 
 		 604 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.404817  normal  0.668551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2223  Transposase-like protein  22.37 
 
 		 604 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000121756  unclonable  0.000000000576961 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  22.03 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  21.78 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2516  Transposase-like protein  21.78 
 
 		 604 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0178846 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2231  transposase IS4 family protein  21.43 
 
 		 573 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.955625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2593  transposase IS4 family protein  21.43 
 
 		 573 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  23.97 
 
 		 596 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  23.97 
 
 		 596 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  21.78 
 
 		 566 aa  53.9  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  19.71 
 
 		 587 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  23.97 
 
 		 596 aa  53.5  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  19.71 
 
 		 587 aa  53.5  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2536  transposase  24 
 
 		 538 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.58057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2854  transposase  24 
 
 		 538 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4811  transposase  24 
 
 		 538 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5390  transposase  26.19 
 
 		 537 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6275  transposase  26.19 
 
 		 537 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584327  normal  0.528904 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>