32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2828 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2828  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0550197  normal  0.193636 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1108  hypothetical protein  97.56 
 
 		 536 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3373  hypothetical protein  97.56 
 
 		 536 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0219057  decreased coverage  0.00537819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2940  hypothetical protein  97.56 
 
 		 536 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0019616  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2697  hypothetical protein  97.56 
 
 		 462 aa  160  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665146  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1742  transposase  51.65 
 
 		 531 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12588  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3656  transposase  51.65 
 
 		 531 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.36895  normal  0.0449577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3280  hypothetical protein  52.75 
 
 		 400 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.338919 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1903  transposase  52.87 
 
 		 417 aa  94.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1600  transposase  45.05 
 
 		 534 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1039  transposase  43.96 
 
 		 534 aa  88.2  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.301792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1188  transposase  45.05 
 
 		 534 aa  88.6  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2698  hypothetical protein  86.67 
 
 		 272 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000472766  normal  0.109857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2711  hypothetical protein  44.94 
 
 		 539 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2780  hypothetical protein  44.94 
 
 		 539 aa  82.8  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  45.56 
 
 		 545 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1188  hypothetical protein  48.15 
 
 		 539 aa  81.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.199037 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1191  hypothetical protein  44.05 
 
 		 534 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3116  hypothetical protein  56.86 
 
 		 507 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0767558  hitchhiker  0.00157639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0683  hypothetical protein  37.04 
 
 		 541 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0472  IS4 family transposase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0815  IS4 family transposase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2191  IS4 family transposase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.694386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2325  IS4 family transposase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.366195  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2378  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0257952  normal  0.284772 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2639  IS4 family transposase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.110889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2846  IS4 family transposase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3565  IS4 family transposase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.050824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3655  IS4 family transposase  28.74 
 
 		 537 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.338356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00174  Transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 544 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02905  Transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 544 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0783  transposase  37.78 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0197343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>