38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1879 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  463  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4666  hypothetical protein  26.85 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4773  hypothetical protein  26.85 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1944  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.190092  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1650  hypothetical protein  26.56 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  27.03 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  27.98 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0558  hypothetical protein  36.9 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  27.07 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  26.47 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  23.01 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  26.5 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  27.39 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  23.53 
 
 		 343 aa  53.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  26.22 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4196  hypothetical protein  27.48 
 
 		 251 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.690464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  25.78 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  26.22 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  23.46 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  30.77 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1633  hypothetical protein  27.2 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  30.38 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  25.26 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  28.98 
 
 		 265 aa  48.5  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3425  hypothetical protein  25.6 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4590  hypothetical protein  23.21 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  25.73 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  35.51 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  22.57 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  21.21 
 
 		 254 aa  45.4  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1023  hypothetical protein  29.74 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  24.42 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  23.84 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  25.88 
 
 		 257 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  25.97 
 
 		 252 aa  42  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>