12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0558 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.212613 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4773  hypothetical protein  63.46 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4666  hypothetical protein  63.46 
 
 		 258 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1650  hypothetical protein  64.23 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1944  protein of unknown function DUF81  51.87 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.190092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  29.01 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  30.8 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  26.69 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  24.75 
 
 		 343 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  27.19 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  28.8 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  25.94 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>