More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1638 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1638  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  100 
 
 		 386 aa  795    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1440  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  71.32 
 
 		 387 aa  593  1e-168  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0102  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 395 aa  474  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0681  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 385 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0554  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 381 aa  353  2e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0486  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 380 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1433  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 380 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.498854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0351  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2180  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1163  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.937878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2045  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 454 aa  277  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1209  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1614  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.193363  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0796  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 459 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0071  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 393 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0929376 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0348  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0463622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1050  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0931794 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1214  Sep-tRNA:Cys-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000547302  normal  0.0195225 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  30.1 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.96 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  29.79 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.51 
 
 		 885 aa  67.8  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  30.77 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  27.94 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.26 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  31.06 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.14 
 
 		 880 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.68 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  29.05 
 
 		 896 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0109  aminotransferase, class V  30.95 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.29 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  27.78 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  28.09 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.17 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  29.5 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.71 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.57 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.53 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.78 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  31.15 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.21 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.09 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  29.48 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.21 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.68 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.94 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  28.85 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  31.21 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.4 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.4 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.19 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.25 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.49 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.65 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  24.24 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.85 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.97 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  27.53 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.84 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.5 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  27.53 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  26.04 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.97 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  29.8 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.97 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.21 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1517  aminotransferase, class V  22.9 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.91 
 
 		 673 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.63 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1204  cysteine desulfurase family protein  29.11 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.515711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4350  aminotransferase  22.9 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.486483  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  26.97 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  25.63 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  24.71 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1003  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.46 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.102523  normal  0.553057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  27.12 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.05 
 
 		 429 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  29.61 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.05 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  27.95 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.4 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.89 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.82 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0084  aminotransferase, class V superfamily protein  27.27 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.153468  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  27.37 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  25.28 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.24 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  25.73 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.07 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.79 
 
 		 674 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.49 
 
 		 572 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.79 
 
 		 672 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04996  cysteine desulfurase  25.41 
 
 		 476 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.66 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.24 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  29.68 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.41 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  24.84 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.42 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>