96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0353 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  100 
 
 
208 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.59 
 
 
210 aa  256  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  59.8 
 
 
210 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  57.14 
 
 
210 aa  248  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  55.39 
 
 
210 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  55.39 
 
 
210 aa  248  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  55.88 
 
 
210 aa  248  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  55.39 
 
 
210 aa  247  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  55.39 
 
 
210 aa  246  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  47.06 
 
 
212 aa  215  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  46.38 
 
 
241 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.08 
 
 
210 aa  184  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.66 
 
 
204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  40.98 
 
 
210 aa  154  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  40.39 
 
 
212 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  43.09 
 
 
206 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  37.44 
 
 
202 aa  148  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  36.46 
 
 
190 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  32.11 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  34.5 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  28.96 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  34.64 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.15 
 
 
189 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  29.55 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  29.21 
 
 
194 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  28.41 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  28.41 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  28.41 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  30.43 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  31.51 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  30.43 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  30.77 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  31.54 
 
 
182 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  29.55 
 
 
184 aa  54.7  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  24.71 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  24.43 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  24.71 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  24.71 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  34.78 
 
 
191 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  23.08 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  28.28 
 
 
181 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  31.03 
 
 
322 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  23.19 
 
 
317 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  23.19 
 
 
317 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  24.55 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  23.91 
 
 
192 aa  52  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.14 
 
 
186 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  24.71 
 
 
190 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.85 
 
 
190 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  28.26 
 
 
182 aa  52  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  33.33 
 
 
187 aa  51.6  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  26.57 
 
 
329 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  29.93 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  23.91 
 
 
333 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  27.92 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  25.68 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  23.91 
 
 
333 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  25.41 
 
 
333 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  28.15 
 
 
190 aa  48.5  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
337 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  22.76 
 
 
321 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 
321 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  26.09 
 
 
337 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  25.56 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  23.58 
 
 
151 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  33.33 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 
388 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  30.77 
 
 
174 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  25.14 
 
 
329 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.85 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1245  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  25.71 
 
 
179 aa  45.8  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  28.19 
 
 
183 aa  45.1  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1780  DJ-1  29.23 
 
 
185 aa  44.7  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 
198 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 
325 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  26.21 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  24.14 
 
 
331 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0481  DJ-1 family protein  31.78 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.476054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3148  intracellular protease, PfpI family  28.57 
 
 
363 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4496  peptidase C56, PfpI  28.07 
 
 
364 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  22.91 
 
 
333 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  28.03 
 
 
366 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1684  ThiJ/PfpI family protein  32.56 
 
 
109 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1834  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.15 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0104188  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 
334 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  26.58 
 
 
202 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  25 
 
 
321 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  23.26 
 
 
318 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  23.88 
 
 
334 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  34.02 
 
 
179 aa  42  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  26.03 
 
 
180 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  24.43 
 
 
202 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 
335 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 
332 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  21.58 
 
 
318 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>