38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4288 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4288  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  212  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4967  Protein of unknown function DUF1778  58.14 
 
 
102 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497468  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2853  hypothetical protein  47.56 
 
 
101 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4538  Protein of unknown function DUF1778  33.73 
 
 
92 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.642193 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2100  Protein of unknown function DUF1778  34.41 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.483017  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  36.36 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2749  hypothetical protein  36.25 
 
 
92 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305261  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1786  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  54.3  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.475504  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1372  hypothetical protein  34.65 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7544  hypothetical protein  37.65 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00766626 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1211  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2494  hypothetical protein  39.71 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176182  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2581  Protein of unknown function DUF1778  39.08 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2941  CopG family protein  44.83 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1621  Protein of unknown function DUF1778  36.25 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3599  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00284675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0956  hypothetical protein  32.63 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4869  hypothetical protein  32.94 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4009  hypothetical protein  35.37 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2855  hypothetical protein  32.91 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1609  hypothetical protein  30.38 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0599595  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4306  Protein of unknown function DUF1778  42.11 
 
 
92 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.956643  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4102  Protein of unknown function DUF1778  27.85 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00360106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2984  hypothetical protein  32.53 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1482  hypothetical protein  27.85 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.431394  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  31.17 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3107  putative ABC-type transport system  31.08 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3092  putative ABC-type transport system  31.08 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.743913  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3024  putative ABC-type transport system  31.08 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3211  putative ABC transporter  31.08 
 
 
93 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.759875  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  36.84 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4348  hypothetical protein  32 
 
 
90 aa  42.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2943  hypothetical protein  38.24 
 
 
99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.197076  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3304  hypothetical protein  32.18 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4861  hypothetical protein  32.18 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2321  Protein of unknown function DUF1778  33.78 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0918  Protein of unknown function DUF1778  29.11 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>