42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3926 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2755  hypothetical protein  38.77 
 
 
964 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446038  normal  0.940253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  47.25 
 
 
913 aa  870    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  44.62 
 
 
969 aa  828    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  44.12 
 
 
962 aa  836    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  44.11 
 
 
954 aa  787    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  42.43 
 
 
954 aa  762    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  43.2 
 
 
952 aa  767    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  43.91 
 
 
956 aa  834    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3705  hypothetical protein  42.65 
 
 
948 aa  792    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2859  AAA ATPase  44.94 
 
 
960 aa  845    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4515  type IV secretory pathway, VirB4 component  43.01 
 
 
983 aa  780    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  47.78 
 
 
913 aa  875    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  44.82 
 
 
962 aa  838    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  44.82 
 
 
962 aa  841    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  43.9 
 
 
955 aa  860    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  44.28 
 
 
963 aa  833    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36280  lipoprotein  42.6 
 
 
973 aa  773    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0859  hypothetical protein  44.4 
 
 
889 aa  779    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  44.63 
 
 
949 aa  855    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0662  hypothetical protein  42.95 
 
 
941 aa  790    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1442  hypothetical protein  44.41 
 
 
1002 aa  805    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.188514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  44.49 
 
 
908 aa  870    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  47.13 
 
 
917 aa  900    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  44.49 
 
 
949 aa  850    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  44.94 
 
 
960 aa  824    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  44.34 
 
 
955 aa  839    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  44.18 
 
 
963 aa  833    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1764  hypothetical protein  41.4 
 
 
938 aa  747    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  43.01 
 
 
980 aa  778    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3926  hypothetical protein  100 
 
 
1042 aa  2170    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  44.86 
 
 
978 aa  849    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1164  hypothetical protein  39.58 
 
 
659 aa  489  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146013  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  26.08 
 
 
916 aa  311  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  26.08 
 
 
916 aa  311  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0614  hypothetical protein  60.18 
 
 
240 aa  305  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  24.36 
 
 
924 aa  294  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  25.3 
 
 
629 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.85 
 
 
847 aa  48.9  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.1 
 
 
629 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.98 
 
 
864 aa  47.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0301  hypothetical protein  23.27 
 
 
818 aa  45.8  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0733022  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  20.37 
 
 
690 aa  45.1  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>