More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0427 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0427  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
453 aa  905    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0240951  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.61 
 
 
463 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.07 
 
 
454 aa  261  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.71 
 
 
458 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
454 aa  249  8e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 
462 aa  240  4e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.29 
 
 
451 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
465 aa  238  2e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.84 
 
 
458 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
562 aa  233  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  30.97 
 
 
584 aa  232  9e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.03 
 
 
463 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
457 aa  231  2e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  31.06 
 
 
585 aa  231  3e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl042  dihydrolipate dehydrogenase  32.53 
 
 
602 aa  230  4e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.84 
 
 
470 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
468 aa  227  3e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.16 
 
 
450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  33.48 
 
 
464 aa  226  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 
473 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
567 aa  226  8e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
465 aa  226  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0228  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.06 
 
 
629 aa  224  3e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.11 
 
 
463 aa  223  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
465 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.15 
 
 
465 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  30 
 
 
478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.83 
 
 
457 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.17 
 
 
457 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.83 
 
 
478 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 
465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.94 
 
 
465 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
462 aa  219  6e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.02 
 
 
465 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  32.18 
 
 
463 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2347  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.18 
 
 
475 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.77 
 
 
473 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
462 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.77 
 
 
477 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 
478 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.38 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.4 
 
 
468 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
473 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  29.27 
 
 
459 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.33 
 
 
478 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  29.27 
 
 
459 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  29.27 
 
 
459 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
473 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.46 
 
 
481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 
482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.04 
 
 
473 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.54 
 
 
478 aa  216  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
474 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.35 
 
 
473 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.35 
 
 
469 aa  216  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
473 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  28.48 
 
 
458 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  28.7 
 
 
458 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 
487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0546  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.07 
 
 
449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.614447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.17 
 
 
476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0532  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.52 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0112141  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1086  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.39 
 
 
587 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0812203  normal  0.813461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.71 
 
 
473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.83 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.17 
 
 
474 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.96 
 
 
476 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.71 
 
 
473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.87 
 
 
562 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.92 
 
 
473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.94 
 
 
476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.94 
 
 
476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
472 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.94 
 
 
476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.94 
 
 
476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.19 
 
 
476 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0736  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.38 
 
 
594 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.871473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.82 
 
 
585 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.96 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
466 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.94 
 
 
476 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.32 
 
 
466 aa  213  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.94 
 
 
476 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  31.26 
 
 
468 aa  212  9e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.29 
 
 
496 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.18 
 
 
539 aa  212  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  28.54 
 
 
460 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  28.48 
 
 
459 aa  212  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.6 
 
 
464 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  28.26 
 
 
457 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.63 
 
 
478 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  29.24 
 
 
452 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.63 
 
 
478 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>