More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0114 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0114  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl091  transcription antitermination factor  61.68 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  34.85 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  31.58 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  35.05 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  30.62 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  32.47 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  32.47 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  35.2 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  31.96 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  31.12 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  36.73 
 
 		 175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  30.77 
 
 		 228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  31.75 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  34.18 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  32.65 
 
 		 177 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  30.69 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  31.98 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  33.33 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  29.47 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  33.01 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  32.99 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  31.1 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  31.53 
 
 		 306 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  32.82 
 
 		 175 aa  111  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  29.63 
 
 		 267 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  34.54 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  31.31 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  33.68 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  30.14 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  32.83 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  32.34 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  32.14 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  31.92 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  30.5 
 
 		 181 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  32.14 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  31.98 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  31.09 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  33.68 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  27.88 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  30.21 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  30.41 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  28.92 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  29.33 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  34.18 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  29.41 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  28.71 
 
 		 280 aa  105  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  31.96 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  30.15 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  31.25 
 
 		 179 aa  105  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  31 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  28.17 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  28.86 
 
 		 173 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  28.86 
 
 		 173 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  31.79 
 
 		 177 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  29.41 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf093  transcription antitermination protein NusG  36.23 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00871231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  30.15 
 
 		 287 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  30.58 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  28.77 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  27.96 
 
 		 320 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  30.14 
 
 		 298 aa  101  9e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  27.27 
 
 		 275 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0685  NusG family protein  29.13 
 
 		 257 aa  100  1e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  28.71 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  30.57 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  25.62 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  26.92 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  31 
 
 		 194 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  32.99 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  32.12 
 
 		 177 aa  99  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  31 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  32.12 
 
 		 177 aa  99  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  25.73 
 
 		 266 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  32.12 
 
 		 177 aa  98.6  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  31.44 
 
 		 177 aa  98.6  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  30.93 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  37.06 
 
 		 176 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  30.46 
 
 		 176 aa  97.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  25.73 
 
 		 271 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  25.73 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  30.35 
 
 		 317 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  25.73 
 
 		 270 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  30.15 
 
 		 193 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  31.44 
 
 		 177 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  31.44 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  30.14 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  31.44 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  30.15 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  24.76 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  30.1 
 
 		 185 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>